Diabetologia：全基因组关联研究鉴定1号染色体上的基因座和1型糖尿病血清C-肽的MHC区域中的多种变体
2018-07-03 MedSci MedSci原创
近日，国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于全基因组关联研究鉴定1号染色体上的基因座和1型糖尿病血清C-肽的MHC区域中的多种变体的研究。这项研究的目的是通过全基因组关联研究（meta-GWAS），用血清C-肽水平来确定1型糖尿病中与β细胞功能相关的遗传变异。 研究人员进行了meta-GWAS，将来自5项1型糖尿病研究的结果与横断面测量的刺激、禁食或随机C-肽水平相结合，其
近日，国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于全基因组关联研究鉴定1号染色体上的基因座和1型糖尿病血清C-肽的MHC区域中的多种变体的研究。这项研究的目的是通过全基因组关联研究（meta-GWAS），用血清C-肽水平来确定1型糖尿病中与β细胞功能相关的遗传变异。
研究人员进行了meta-GWAS，将来自5项1型糖尿病研究的结果与横断面测量的刺激、禁食或随机C-肽水平相结合，其中包括3479名欧洲参与者。考虑样本量和效应方向，将各研究中的p值合并。研究人员还针对受刺激（n = 1303），空腹（n = 2019）和随机（n = 1497）C-肽水平进行了单独的meta-GWAS 。
在用于刺激/禁食/随机C肽水平的meta-GWAS中，1号染色体上的SNP rs559047（Chr1：238753916，T> A，次要等位基因频率[MAF] 0.24-0.26）与C-肽p
=
4.13×10 -8），满足全基因组显著性阈值（p <5×10 -8）。在相同的元GWAS，MHC区域（rs9260151）的轨迹接近全基因组显著性阈值（CHR 6：29911030，C>
T，MAF 0.07-0.10，p =
8.43×10 -8）。在受刺激的C-肽meta-GWAS中，MHC区中的rs61211515（Chr6：30100975，T / - ，MAF 0.17-0.19）与刺激的C-肽相关（β[SE] = - 0.39 [0.07]，p =
9.72×10 -8）。rs61211515也与刺激的C-肽的下降速度相关在个体（的一个子集相关联的随着时间的推移Ñ = 258）以每年重复测量长达6年（p
= 0.02）。在随机C-肽的meta-GWAS中，另一个MHC区SNP rs3135002（Chr6：32668439，C> A，MAF
0.02-0.06）与C-肽相关（p =
3.49×10 -8）。有条件的分析表明，MHC区域中三种鉴定的变体彼此独立。rs9260151和rs3135002与1型糖尿病有关，而rs559047和rs61211515与1型糖尿病的发病风险无关。
研究人员在1号染色体上鉴定了一个基因座和MHC区域中的多个变异体，其中至少有一些变异体与1型糖尿病风险基因座不同，它们与C肽相关，提示部分非重叠的机制可用于研究1型糖尿病的发生发展机制。这些关联需要在独立人群中进行验证。进一步的研究可以提供对β细胞损失机制的认识和保护β细胞功能的时机。
原始出处：
Delnaz Roshandel, Rose Gubitosi-Klug, Shelley B. Bull，et al. Meta-genome-wide
association studies identify a locus on chromosome 1 and multiple variants in
the MHC region for serum C-peptide in type 1 diabetes
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