Blood:新发现16个静脉血栓栓塞的遗传易感位点!

2019-08-18 MedSci MedSci原创

静脉血栓栓塞(VTE)是一种高发病率和高死亡率的疾病。为进一步深入了解促进VTE发生的生理机制,研究人员对VTE患者进行全基因组关联研究(GWAS)和全基因组关联研究(TWAS)和基于全血和肝脏基因表达的全转录组关联研究(TWAS)。研究人员对18个队列的30 234位VTE患者和172 122位对照的GWAS数据进行Meta分析,来评估12 923 718个遗传变异与VTE的相关性。研究人员从全

静脉血栓栓塞(VTE)是一种高发病率和高死亡率的疾病。为进一步深入了解促进VTE发生的生理机制,研究人员对VTE患者进行全基因组关联研究(GWAS)和全基因组关联研究(TWAS)和基于全血和肝脏基因表达的全转录组关联研究(TWAS)。

研究人员对18个队列的30 234位VTE患者和172 122位对照的GWAS数据进行Meta分析,来评估12 923 718个遗传变异与VTE的相关性。研究人员从全血和肝组织来源的数据计算基因表达的变异预测分数,并评估其与VTE的相关性。对与新的VTE位点相关的性状进行孟德尔随机化分析。

最终,研究人员从GWAS Meta分析中确定了34个VTE风险的独立遗传信号,其中14个是新发现的。这包括11个新的相关的遗传位点(C1orf198、PLEK、OSMR-AS1、NUGGC/SCARA5、GRK5、MPHOSPH9、ARID4A、PLCG2、SMG6、EIF5A、STX10),其中6个在3个已知基因中重复出现,3个为新发现的独立信号。

此外,TWAS还从全血和肝脏中发现了5个额外的基因表达水平在患者中存在差异,且不同于对照组的遗传位点(全血:SH2B3、SPSB1、RP11-747H7.3、RP4-737E23.2;肝脏:ERAP1)。在部分GWAS位点上,研究人员还找到了新的和已知区域的VTE相关信号与eQTL信号共定位的提示证据。随机化分析表明,血液特征可能是VTE的潜在危险因素之一。

综上所述,本研究确定了16个新的VTE易感位点;其中部分位点的关联信号可能是通过临近基因的表达介导的。

原始出处:

Sara Lindstrom, et al. Genomic and Transcriptomic Association Studies Identify 16 Novel Susceptibility Loci for Venous Thromboembolism. Blood 2019 :blood.2019000435; doi: https://doi.org/10.1182/blood.2019000435

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  1. 2019-08-22 最帅小男护

    怎么说呢

    0

  2. 2019-08-20 Midas

    命运一说更是迷人

    0

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