eBioMedicine:75万细胞级跨模态图谱,人类骨骼肌转录组学迎来统一参考标准
2026-09-02 清泉心田 MedSci原创 发表于上海
本研究首次整合多来源、多模态的人类骨骼肌转录组数据,建立了标准化的整合参考图谱与配套在线注释工具,解决了领域内细胞注释不统一、跨研究可比性差的核心痛点。
深度解析医学证据,DeepEvidence为你支撑决策 单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)与单细胞核 RNA 测序(snRNA-seq)技术极大提升了骨骼肌细胞异质性与胞内信号网络的解析精度,但领域内长期缺乏统一的细胞分类体系与标准化参考框架。不同研究间样本处理流程、测序平台和细胞注释策略的差异,严重制约了研究结果的可重复性与跨研究比较价值。在其他器官系统中,人类细胞图谱、Tabula Sapiens 等大规模整合资源已成为转录组数据解读的标准基底,但骨骼肌的功能单位,肌纤维为多核合胞体结构,仅靠单细胞测序无法完整覆盖所有细胞类群,现有研究数据碎片化问题突出,建立共识性的整合参考图谱已成为骨骼肌转录组研究的迫切需求。 研究系统检索 PubMed 与基因表达综合数据库(GEO)中成人骨骼肌 scRNA-seq 及 snRNA-seq 数据集,经筛选最终纳入 7 项符合标准的研究,覆盖 88 名健康个体的测序数据。研究采用统一质控标准过滤低质量细胞与细胞核,对比 Harmony、典型相关分析(CCA)、反向主成分分析(RPCA)三种整合算法,选择最优策略构建联合参考图谱。研究分别针
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