eBioMedicine:75万细胞级跨模态图谱,人类骨骼肌转录组学迎来统一参考标准

2026-09-02 清泉心田 MedSci原创 发表于上海

本研究首次整合多来源、多模态的人类骨骼肌转录组数据,建立了标准化的整合参考图谱与配套在线注释工具,解决了领域内细胞注释不统一、跨研究可比性差的核心痛点。

深度解析医学证据,DeepEvidence为你支撑决策 单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)与单细胞核 RNA 测序(snRNA-seq)技术极大提升了骨骼肌细胞异质性与胞内信号网络的解析精度,但领域内长期缺乏统一的细胞分类体系与标准化参考框架。不同研究间样本处理流程、测序平台和细胞注释策略的差异,严重制约了研究结果的可重复性与跨研究比较价值。在其他器官系统中,人类细胞图谱、Tabula Sapiens 等大规模整合资源已成为转录组数据解读的标准基底,但骨骼肌的功能单位,肌纤维为多核合胞体结构,仅靠单细胞测序无法完整覆盖所有细胞类群,现有研究数据碎片化问题突出,建立共识性的整合参考图谱已成为骨骼肌转录组研究的迫切需求。 研究系统检索 PubMed 与基因表达综合数据库(GEO)中成人骨骼肌 scRNA-seq 及 snRNA-seq 数据集,经筛选最终纳入 7 项符合标准的研究,覆盖 88 名健康个体的测序数据。研究采用统一质控标准过滤低质量细胞与细胞核,对比 Harmony、典型相关分析(CCA)、反向主成分分析(RPCA)三种整合算法,选择最优策略构建联合参考图谱。研究分别针

相关资料下载:
[AttachmentFileName(sort=1, fileName=PIIS235239642600349X.pdf)] GetArticleByIdResponse(id=c76a9491e525, projectId=1, sourceId=null, title=eBioMedicine:75万细胞级跨模态图谱,人类骨骼肌转录组学迎来统一参考标准, articleFrom=MedSci原创, journalId=12746, copyright=原创, creationTypeList=[1], summary=本研究首次整合多来源、多模态的人类骨骼肌转录组数据,建立了标准化的整合参考图谱与配套在线注释工具,解决了领域内细胞注释不统一、跨研究可比性差的核心痛点。, cover=https://img.medsci.cn/20260122/1769064959705_5478063.png, authorId=0, author=清泉心田, originalUrl=, linkOutUrl=, content=深度解析医学证据,DeepEvidence为你支撑决策 单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)与单细胞核 RNA 测序(snRNA-seq)技术极大提升了骨骼肌细胞异质性与胞内信号网络的解析精度,但领域内长期缺乏统一的细胞分类体系与标准化参考框架。不同研究间样本处理流程、测序平台和细胞注释策略的差异,严重制约了研究结果的可重复性与跨研究比较价值。在其他器官系统中,人类细胞图谱、Tabula Sapiens 等大规模整合资源已成为转录组数据解读的标准基底,但骨骼肌的功能单位,肌纤维为多核合胞体结构,仅靠单细胞测序无法完整覆盖所有细胞类群,现有研究数据碎片化问题突出,建立共识性的整合参考图谱已成为骨骼肌转录组研究的迫切需求。 研究系统检索 PubMed 与基因表达综合数据库(GEO)中成人骨骼肌 scRNA-seq 及 snRNA-seq 数据集,经筛选最终纳入 7 项符合标准的研究,覆盖 88 名健康个体的测序数据。研究采用统一质控标准过滤低质量细胞与细胞核,对比 Harmony、典型相关分析(CCA)、反向主成分分析(RPCA)三种整合算法,选择最优策略构建联合参考图谱。研究分别针, belongTo=, tagList=[TagDto(tagId=529985, tagName=单细胞 RNA 测序), TagDto(tagId=529986, tagName=骨骼肌转录组学)], categoryList=[CategoryDto(categoryId=10, categoryName=骨科, tenant=100), CategoryDto(categoryId=84, categoryName=研究进展, tenant=100), CategoryDto(categoryId=20656, categoryName=梅斯医学, tenant=100)], articleKeywordId=0, articleKeyword=, articleKeywordNum=6, guiderKeywordId=0, guiderKeyword=, guiderKeywordNum=6, opened=0, paymentType=1, paymentAmount=5, recommend=0, recommendEndTime=null, sticky=0, stickyEndTime=null, allHits=304, appHits=1, showAppHits=0, pcHits=24, showPcHits=303, likes=0, shares=0, comments=0, approvalStatus=1, publishedTime=Wed Sep 02 15:20:00 CST 2026, publishedTimeString=2026-09-02, pcVisible=1, appVisible=1, editorId=6556091, editor=骨科新前沿, waterMark=0, formatted=0, deleted=0, version=3, createdBy=98af8624274, createdName=清泉心田, createdTime=Tue Sep 01 14:16:43 CST 2026, updatedBy=92910, updatedName=rayms, updatedTime=Wed Sep 02 15:11:05 CST 2026, ipAttribution=上海, attachmentFileNameList=[AttachmentFileName(sort=1, fileName=PIIS235239642600349X.pdf)], guideDownload=1, surveyId=null, surveyIdStr=null, surveyName=null, pushMsXiaoZhi=true, qaList=[{id=2572654, encryptionId=837625e2654cf, articleId=c76a9491e525, userName=administrator, question=NOVA1作为FAPs新型标志物的临床意义是什么?, answer=NOVA1具有97%的高特异性,可精准识别成纤维脂肪生成祖细胞,为研究肌肉纤维化、脂肪浸润等病理过程提供新的分子靶点和诊断标志物。, clickNum=0, type=article, createdAt=1788333086186, updatedAt=1788333086186}, {id=2572652, encryptionId=eff125e2652bb, articleId=c76a9491e525, userName=administrator, question=单细胞RNA测序和单细胞核RNA测序在骨骼肌研究中各有什么优势和局限性?, answer=单细胞RNA测序(scRNA-seq)能解析完整细胞的转录组信息,但对多核肌纤维等合胞体结构覆盖不全;单细胞核RNA测序(snRNA-seq)可捕获难以分离的细胞核信息,但可能丢失部分胞质RNA。两者互补才能全面揭示骨骼肌细胞异质性。, clickNum=0, type=article, createdAt=1788333086186, updatedAt=1788333086186}, {id=2572656, encryptionId=faa225e2656ca, articleId=c76a9491e525, userName=administrator, question=该研究开发的在线注释工具相比通用工具CHETAH有何优势?, answer=针对骨骼肌组织优化的专用工具在独立验证中表现更优,能更准确识别肌特异性细胞亚群,解决了通用工具对组织特异性细胞注释不准的问题。, clickNum=0, type=article, createdAt=1788333086186, updatedAt=1788333086186}])
PIIS235239642600349X.pdf
评论区 (1)
#插入话题
  1. [GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=2363007, encodeId=3277236300ef1, content=<a href='/topic/show?id=8cd4144e97eb' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#单细胞 RNA 测序#</a> <a href='/topic/show?id=65b7144e9813' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#骨骼肌转录组学#</a>, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=7, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[TopicDto(id=144797, encryptionId=8cd4144e97eb, topicName=单细胞 RNA 测序), TopicDto(id=144798, encryptionId=65b7144e9813, topicName=骨骼肌转录组学)], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=null, createdBy=cade5395722, createdName=梅斯管理员, createdTime=Wed Sep 02 15:11:05 CST 2026, time=2026-09-02, status=1, ipAttribution=上海)]