Circulation:血浆蛋白质组学联合单细胞转录组学“排序”心梗后心衰标志物

2020-10-15 星云 MedSci原创

心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。

心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。

Chan等使用了基于适体的亲和力捕获血浆蛋白质组学,检测了新西兰队列(CDCS [冠心病队列研究])中MI患者发病后1个月时的1305种血浆蛋白,包括181名MI后随后因HF住院的患者,与250名MI后中位随访4.9年中未发生事件的患者对比。

研究流程

1128种蛋白的火山图

在CDCS队列中,212种差异性表达的血浆蛋白与随后的HF事件显著相关。其中96例与MI后4个月测得的左心室射血分数相关。加权基因共表达网络分析对212种蛋白质中的63种进行了优先排序,与无事件对照相比,这些蛋白与MI后HF患者之间的相关性明显更高,而单细胞转录组鉴定出15种候选基因蛋白。大多数优先蛋白质是母细胞来源的。

血浆蛋白网络分析

6种最高度富集的蛋白在三种分析中共有,包括已明确的MI后HF的生物标志物:B型N端利钠肽和肌钙蛋白T,和新兴的标志物,血管生成素-2、血小板反应蛋白-2、潜在转化生长因子-β结合蛋白-4和卵泡抑素相关蛋白-3

前6种候选蛋白

总之,大规模人血浆蛋白质组学,在单细胞分辨率下与无偏倚的心脏转录组学交叉分析,可为进一步进行MI后HF的机制研究和临床验证试验提供优先考虑的蛋白质候选物。

MI后HF的总结

原始出处:

Mark Y. Chan, et al. Prioritizing Candidates of Post–Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics. Circulation. 2020;142:1408–1421

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  1. 2020-10-27 Lexi

    大规模人血浆蛋白质组学,在单细胞分辨率下与无偏倚的心脏转录组学交叉分析,可为进一步进行MI后HF的机制研究和临床验证试验提供优先考虑的蛋白质候选物。

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