Clin Chem:基于DNA甲基化检测循环肿瘤DNA新方法?

2020-08-01 MedSci原创 MedSci原创

本研究通过胞嘧啶转化后同时测量有义和反义DNA链增强DNA甲基化标记的性能。大多数现有的基于DNA甲基化的循环肿瘤DNA(ctDNA)检测方法都是基于未甲基化的胞嘧啶向尿嘧啶的转化。

本研究通过胞嘧啶转化后同时测量有义和反义DNA链增强DNA甲基化标记的性能。大多数现有的基于DNA甲基化的循环肿瘤DNA(ctDNA)检测方法都是基于未甲基化的胞嘧啶向尿嘧啶的转化。转换后,两条DNA链不再互补。 因此,靶向1条DNA链仅利用了可用DNA的一半信息。我们研究了通过在亚硫酸氢盐转化后靶向两条DNA链是否可以提高基于甲基化的ctDNA检测策略的敏感性。

针对3种结直肠癌(CRC)特异性甲基化标记KCNQ5、C9orf50和CLIP4设计了双链数字PCR检测方法,并与之前报道的单链检测方法进行了比较。我们在肿瘤和白细胞DNA中测试了性能,并在43例CRC I - IV期患者和42例经结肠镜检查证实的健康对照者的血浆中研究了ctDNA的检测能力。

双链分析定量了接近100%的甲基化对照DNA输入,而单链分析定量大约为50%。此外,双链分析显示,当应用于从肿瘤组织和CRC患者血浆中纯化的DNA时,检测到的甲基化DNA拷贝数增加了2倍。将3个DNA甲基化标记的结果结合到ctDNA检测测试中并应用于血浆,双链分析方法检测出86%的癌症,而单链分析方法检测出74%的癌症。对于双链和单链测试,特异性均为100%。

研究结果表明,双链检测比单链检测对甲基化ctDNA的检测更敏感。

原始出处:

Sarah Ø Jensen, Nadia Øgaard, Enhanced Performance of DNA Methylation Markers by Simultaneous Measurement of Sense and Antisense DNA Strands after Cytosine Conversion

版权声明:
本网站所有注明“来源:梅斯医学”或“来源:MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明“来源:梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,转载内容不代表本站立场。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (1)
#插入话题
  1. 2020-08-02 金生辉

    cfDNA与ctDNA相比,哪个指标意义最大呢?

    0

相关资讯

Sci Transl Med:循环肿瘤DNA甲基化谱有助于结直肠癌的早期诊断及预后预测

血液循环肿瘤DNA(ctDNA)的检测是一种非侵入性的检查方法,如果我们知道每种癌症的正确标志物,则可在早期检测出癌症的存在。目前,ctDNA已成为多种癌症有用的诊断和预后生物标志物。现研究人员开展一项研究,以评估ctDNA甲基化标志物用于结直肠癌(CRC)的诊断和预后中的潜在应用,并通过一项前瞻性队列来验证其在筛查高CRC风险的患者中的有效性。研究人员首先通过比较CRC组织和正常血液白细胞来识别

Gastroenterology:放化疗后循环肿瘤DNA与食管癌患者进展风险

研究认为,食管癌放化疗后,循环肿瘤DNA检测阳性与肿瘤的进展、转移和疾病特异性存活有关,可用于鉴别肿瘤进展风险最高的患者。

新的乳腺癌血液检查可提前两年诊断出癌症复发

伦敦帝国理工学院和莱斯特大学的一项新研究发现,对于早期乳腺癌患者的诊断,一项简单的血液检测可提前两年检测出乳腺癌的复发。

Blood:循环血中的肿瘤DNA可用于预测AML/MDS患者造血干细胞移植后的复发风险

中心点:异基因移植后持续检测血清循环肿瘤DNA (ctDNA)可预测AML和MDS的复发。检测ctDNA(包括DNMT3A、TET2和ASXL1)的预测价值,可媲美于匹配的BM中的持续性突变的预测价值。摘要:Sousuke Nakamura等研究人员开展一研究,评估肿瘤来源的DNA片段或循环中的肿瘤DNA (ctDNA)在确定急性髓系白血病和骨髓增生异常综合征(AML/MDS)患者清髓性异基因造血

CLIN CANCER RES:胃食管腺癌患者循环肿瘤DNA与临床结局之间的关系

食管,胃食管交界和胃腺癌(胃食管腺癌)预后较差,缺乏有效的全身治疗选择CLIN CANCER RES近期发表了一篇文章,通过二代测序(NGS)评估患者血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA),以进一步了解胃食管癌的基因组信息及其临床相关性。

CLIN CANCER RES:循环肿瘤DNA出现RAS紧急突变对帕尼单抗治疗转移性结直肠癌的影响

抗EGFR治疗期间出现RAS突变可能是获得抗EGFR治疗耐药的机制,从而引起人们关注。循环肿瘤(ct)DNA检测是一种确定RAS突变状态的微创且高敏感的方法。CLIN CANCER RES近期发表了一篇文章,研究治疗期间循环肿瘤DNA出现RAS紧急突变对转移性结直肠癌治疗耐药的影响。