小RNA是调控基因表达和分化的关键分子。然而，许多不同种类的小RNA (sRNAs)具有不同的生物发生途径，因此可能具有不同的生化特性。为了通过深度测序分析sRNAs，互补DNA合成需要对RNA分子本身进行操作。因此，由于生化标准的存在，建文库过程中的酶活性会对文库的内容产生偏差。
我们比较了四种不同的RNA制备文库操作：（a）基于连接的方法仅允许5'-单磷酸化RNA进入文库，（b）基于连接的方法允许额外的5'-三磷酸和Cap结构 ，（c）基于连接的，基于模板转换的文库制备，和（d）基于模板转换的库制备，使3'-磷酸化的RNA进入文库。
我们的数据显示，依赖连接和依赖连接的文库在它们对单个sRNA类（如microRNA（miRNA），Piwi相互作用RNA（piRNA）和转移RNA片段）的偏好方面存在很大差异。 此外，两种方法的miRNA组成不同，经过焦磷酸酶处理后可以识别出更多的microRNA亚型(isomiRs)。piRNAs在模板转换库中得到了丰富，这一过程显然包含了更多不同种类的RNA。
我们的数据表明，两种方法的miRNA组学几乎没有可比性。基于连接的文库丰富了典型miRNA，可能是适合miRNA组学研究的方法。模板转换库包含数量增加的片段和长RNAs的不同组成。连接无关的文库似乎显示了一个更真实的sRNA表达谱，对生化修饰的偏倚更低。
原始出处：
本文系梅斯医学（MedSci）原创编译整理，转载需授权！
版权声明：
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料，版权均属于梅斯医学所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章，或“梅斯号”自媒体发布的文章，仅系出于传递更多信息之目的，本站仅负责审核内容合规，其内容不代表本站立场，本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
在此留言
#比较分析#
32
学习
78
很好的学习机会
76
#小RNA#
37