A&R:自身免疫性疾病中抗SSA/Ro60抗体表达的共同特征
2022-06-08 MedSci原创 MedSci原创
RNA-Seq、DNA甲基化和GWAS数据的选定特征允许明确区分抗Ro60+和抗 Ro60-患者。抗Ro60+患者无论其疾病如何都会表现出特定的炎症特征。
目的:抗Ro自身抗体是最常检测到的可提取核抗原自身抗体之一,主要与原发性干燥综合征(pSS)、系统性红斑狼疮(SLE)和未分化结缔组织病(UCTD)相关。在所有表达抗Ro60自身抗体的患者不同疾病的表现型中,是否有共同的特征?
方法:使用从PRECISESADS IMI项目的横截面队列中收集的高通量多组学数据(遗传、表观基因组学、转录组学,结合流式细胞术数据、多重细胞因子、经典血清学和临床数据),研究人员通过机器学习评估了综合520名抗Ro60阳性(anti-Ro60+)与511名抗Ro60 阴性(anti-Ro60-)的pSS、SLE和UCTD患者以及279名健康对照(HCs)的分子谱分析。
结果:RNA-Seq、DNA甲基化和GWAS数据的选定特征允许明确区分抗Ro60+和抗 Ro60-患者。通过机器学习从抗Ro60+患者中选择的与抗Ro60-患者和健康对照相比的不同特征构成了特定特征谱。值得注意的是,由Boruta算法独立鉴定的与低甲基化和遗传变异相关的三个基因(ATP10A、MX1和PARP14)的转录z评分,抗Ro60 +患者与抗Ro60-所有疾病的患者相比明显更高。经证明,这些富含干扰素刺激基因的特征也在患有类风湿性关节炎和系统性硬化症的抗Ro60+患者中发现,并且随着时间的推移保持稳定,不受治疗的影响。
结论:抗Ro60+患者无论其疾病如何都会表现出特定的炎症特征,这表明应考虑针对Ro相关RNA和抗Ro60自身抗体的双重治疗方法。
出处:Foulquier, N., Le Dantec, C., Bettacchioli, E., Jamin, C., Alarcón-Riquelme, M.E. and Pers, J.-O. (2022), Machine learning identifies a common signature for anti-SSA/Ro60 antibody expression across autoimmune diseases. Arthritis Rheumatol. Accepted Author Manuscript. https://doi.org/10.1002/art.42243
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