Nat Commun:全基因组荟萃分析鉴定127个原发性开角型青光眼相关基因座

2021-03-05 xiaozeng MedSci原创

原发性开角型青光眼(POAG)是不可逆性失明的主要原因之一。该疾病的特征是进行性视神经变性,通常伴有眼内压升高(IOP)。

原发性开角型青光眼(POAG)是不可逆性失明的主要原因之一。该疾病的特征是进行性视神经变性,通常伴有眼内压升高(IOP)。目前尚无相关的神经保护疗法,该疾病的治疗也仅限于降低眼压,这会减缓疾病的早期进展。然而,超过50%的青光眼患者直到发生不可逆的视神经损害才被诊断出来。

POAG是高度可遗传的,既往的全基因组关联研究(GWAS)已确定了与POAG发病风险相关的重要基因座。尽管目前关于该疾病已取得了一定的成功,但POAG的遗传状况研究仍然不完整,还需要确定其他的风险位点以进一步鉴定潜在的预防性治疗靶点。

为了识别风险基因座,研究人员采用全基因组关联研究进行了大型的多族裔荟萃分析。通过研究了总共34,179例病例和349,321例对照,研究人员鉴定了44个先前未报告的风险基因座,以及83个先前已知的基因座。

相关研究流程图

结果显示,大多数的基因座在欧洲、亚洲和非洲人群中具有广泛一致的影响。该跨族裔数据改善了几个基因座因果变异的精细映射。多种遗传证据的整合揭示了已鉴定的POAG风险基因座的功能相关性,并突出了几种基因对POAG发病机制的潜在贡献,这些基因包括SVEP1、RERE、VCAM1、ZNF638、CLIC5、SLC2A12、YAP1、MXRA5和SMAD6。

跨族裔分析的曼哈顿图

综上,该研究结果确定了欧洲、亚洲和非洲人之间POAG的跨族裔遗传相关性,并通过相关GWAS结果鉴定了127个全基因组重要基因座。该跨族裔的数据也改善了因果变异的精细映射。该研究也揭示了,靶向POAG风险基因的几种药物可能是潜在的青光眼治疗候选药物。


原始出处:

Gharahkhani, P., Jorgenson, E., Hysi, P. et al. Genome-wide meta-analysis identifies 127 open-angle glaucoma loci with consistent effect across ancestries. Nat Commun 12, 1258 (24 February 2021).

 

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