PNAS：香港科大运用大数据分析艾滋病病毒结构
2018-02-08 张雅诗 新华网
香港科技大学7日宣布，该校一支跨学科研究团队发现了一个有效的电脑方程式框架，能分析艾滋病病毒中一种关键蛋白（简称gp160）的健康状态，有助将来研发艾滋病疫苗。
香港科技大学7日宣布，该校一支跨学科研究团队发现了一个有效的电脑方程式框架，能分析艾滋病病毒中一种关键蛋白（简称gp160）的健康状态，有助将来研发艾滋病疫苗。
港科大的化学及生物工程学系和电子及计算机工程学系，携手美国麻省理工学院运用大数据计算出艾滋病病毒中gp160的健康状态，包括其复制和传播能力等，这有助科学家找出病毒逃避抗体的路径，有可能从而设计出有效的疫苗。
港科大电子及计算机工程学系兼化学及生物工程学系教授麦凯介绍，抗体的功效取决于它粘合在病毒包膜蛋白的位置，若粘合在其最健康强壮的位置则能发挥最大功效。虽然现在已有一些能破坏艾滋病病毒的抗体，但艾滋病病毒能通过突变来逃避抗体。
研究人员利用这一新的电脑方程式，处理了1918名艾滋病患者共20043个蛋白列序样本，通过比较各种实验测量值以验证他们的推断结果。
麦凯表示，研发出艾滋病预防疫苗是最终目标，他们这个方程式框架能为疫苗设计提供线索，至于实际效能则仍有待研究。他说，这框架也能应用于其他突变度高的病毒，例如丙型肝炎。
这项研究成果已在国际科学期刊《美国国家科学院院刊》上发表。
原始出处：
Raymond H. Y. Louie,et al.Fitness landscape of the human immunodeficiency virus envelope protein that is targeted by antibodies.PNAS 2018 January, 115 (4) E564-E573.
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