DNA甲基化谱分析归类为「幕上室管膜瘤，YAP1融合阳性」，未检出YAP1融合却发现TEAD1::NCOA2融合

背 景

新近报道的颅内肿瘤——幕上室管膜瘤，YAP1融合阳性（ST-EPN-YAP1）被纳入最新版世界卫生组织（WHO）中枢神经系统（CNS）肿瘤分类中。该肿瘤最常见于幼儿的大脑半球，尤其是女童，其特征为嗜酸性颗粒小体、广泛而强烈的EMA免疫阳性以及缺乏NF-κB或L1CAM免疫反应。本文报告一例具有ST-EPN-YAP1所有特征的儿童肿瘤，但该肿瘤携带TEAD1::NCOA2融合。

▲摘自《2021年第五版WHO中枢神经系统肿瘤分类》

病 例

患童女，1 岁，因颅内高压就诊。计算机断层扫描显示左侧大脑半球有一个大的实性和囊性成分肿块，实性部分呈中等密度并伴有钙化。磁共振成像（MRI）显示左侧侧脑室内有一个大肿块，伴有明显强化和弥散受限（图1A-H）。肿瘤行次全切除。肿瘤与脑实质边界清楚，由形态一致的细胞组成，可见一些假菊形团、菊形团和嗜酸性颗粒小体（图1I-J）。可见坏死，但无微血管增生。核分裂象计数和增殖指数均较低。免疫组织化学显示INI1和BRG1表达保留。肿瘤细胞强表达GFAP（图1K），OLIG2、LIN28A、L1CAM和NF-κB均无免疫阳性（仅见胞质染色）。EMA免疫染色呈弥漫点状和微腔表达（图1L）。YAP1荧光原位杂交（FISH）未发现任何重排。DNA甲基化谱分析（v12.8）将该肿瘤归类为ST-EPN-YAP1（校准分数为0.79），经均匀流形近似和投影证实（图2A）。RNA测序证实存在TEAD1::NCOA2融合（图2B）。随后进行了全切除，未行任何辅助治疗。初始诊断后 100 个月，患童无残留存活。

▲图1 影像和组织学特征

▲图2 分子特征

讨 论

ST-EPN-YAP1在分子水平上由YAP1基因融合定义，主要与MAMLD1相关，但也有其他基因伙伴的报道。该融合诱导HIPPO-YAP/TAZ通路的激活。YAP和TAZ蛋白在核转位后，与转录调节因子（主要是TEAD转录因子家族）相互作用，以调节与细胞生长和细胞稳态相关的基因表达。本病例展示了一例携带TEAD1::NCOA2易位的室管膜瘤，Panferova A等人同时也对此进行了描述。该融合先前在硬化性/梭形细胞横纹肌肉瘤中被报道，已知其可激活HIPPO通路。该病例与经典ST-EPN-YAP1具有临床、影像学和组织病理学相似性。DNA甲基化谱分析与该诊断一致，但校准分数<0.9，这可能是由于当前分类器中仅纳入了具有YAP1融合的ST-EPN。

总之，本文报告了一例携带TEAD1::NCOA2易位且与YAP1融合阳性组具有相似性的ST-EPN。需要更多病例来确定其是否代表ST-EPN-YAP1的分子变异型，或是一种无YAP1和ZFTA融合的室管膜瘤新亚型。

中枢神经系统肿瘤全基因组甲基化检测（基因芯片方法学），覆盖了CpG岛、启动子、编码区及增强子区域共约100万个CpG位点，筛选样本中的DNA甲基化位点，并与数据库中已知样本信息进行比较聚类分析，辅助中枢神经系统肿瘤的精准诊断及分子分型，同时包括了染色体拷贝数变异分析。

▲我司中枢神经系统肿瘤全基因组甲基化检测报告（部分）

此外，脑肿瘤460基因+RNA1560基因检测（NGS方法学）面向室管膜瘤等中枢神经系统肿瘤患者，基于杂交捕获建库+NGS测序，提取DNA样本，检测460个基因的SNV、indel等变异，同时提取RNA样本，检测TEAD1::NCOA2融合在内至少1560种已知和数百个基因相关未知融合变异，预测可能获益的靶向、免疫、化疗等治疗方案，同时辅助预后和遗传风险评估。

参考文献：

Tauziède-Espariat A, Appay R, Bouvier C, Testud B, Girard N, Métais A, Servant E, Scavarda D, Meurgey A, Pissaloux D, Hasty L, Varlet P; RENOCLIP-LOC. A novel TEAD1::NCOA2 fusion that potentially expands the concept of supratentorial ependymoma, YAP1 fusion-positive. Acta Neuropathol. 2025 Feb 10;149(1):14. doi: 10.1007/s00401-025-02852-z. PMID: 39928140; PMCID: PMC11811449.