Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制,这将丰富AS单细胞研究的数据,为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎,整合单细胞RNA-SEQ,ATAC-SEQ - 2022-02-19
Blood:单细胞RNA-seq可揭示非整倍体造血细胞的特异性转录本。
癌细胞常发生染色体异常。特定的细胞遗传变异常可用于预测结局,特别是对于血液肿瘤,例如常发生于恶性髓性血液病的7号染色体的单倍体。一直以来,由于缺乏将非整倍体细胞与二倍体细胞区分的标志物,很难在细胞水平研究非整倍体对功能的影响。
MedSci原创 - 单细胞RNA-seq,造血细胞,单倍体 - 2017-10-15
Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析揭示了人类骨关节炎的进展
这项研究结果为软骨细胞分类学提供了新的见解,并为人类OA软骨再生的有效和功能性操作提供了潜在线索。
MedSci原创 - 骨关节炎,RNA-seq分析,软骨细胞,HTCs - 2018-07-24
Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析可以识别半月板祖细胞并揭示半月板变性的进展
识别半月板祖细胞为基于细胞的半月板组织工程学提供了全新的角度,并证明了半月板变性的新机制,而这有助于开发新的治疗策略。
MedSci原创 - 半月板变性,单细胞RNA-seq分析,半月板祖细胞,DegP - 2020-01-07
SCI REP:利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染
近日,国际杂志 《SCI REP》在线发表一项关于利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染的研究。
MedSci原创 - 感染,细菌 - 2017-08-06
基于英国“10万人基因组计划”转录组数据,揭示RNA-seq对罕见疾病的诊断潜力
该研究对英国“十万人基因组计划”(UK100K)中一个大型患者队列的转录组数据进行了初步分析,揭示了RNA-seq在改善罕见疾病诊断方面的潜力。
测序中国 - RNA-Seq,RNA测序,罕见疾病 - 2023-06-28
Nat Genet:WES联合RNA-seq分析揭示晚期NSCLC免疫治疗的基因组学和转录组学特征
通过对基因组特征以及已有的免疫和肿瘤生物学相关特征的综合分析,发现了不同信号通路和不同细胞类型之间复杂相互作用的现象,进一步揭示了免疫检查点抑制剂治疗背后的多维度相互作用。
测序中国 - NSCLC免疫治疗 - 2023-05-06
Cell:革命性单细胞研究工具CellHint,可自动化整合多种人类单细胞图谱数据集
研究团队报道了最新开发的变革性工具—CellHint,这是一种基于预测聚类树(PCT)的工具,可解决数据集之间在注释分辨率和技术偏差方面的细胞类型差异。
测序中国 - CellHint,单细胞图谱 - 2024-01-25
Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-seq
在不同细胞群中表征不同组蛋白修饰的大规模研究工作通常使用染色质免疫沉淀测序法(ChIP-seq)来完成,但每个单细胞只能检测一个组蛋白修饰。
测序中国 - 单细胞组蛋白,蛋白修饰抗体 - 2023-02-06
Nat Genet:基于健康单细胞参考图谱准确识别scRNA-seq数据中疾病相关细胞状态
研究团队评估了单细胞参考图谱的选择如何影响从疾病样本scRNA-seq数据中识别细胞状态变化。
测序中国 - scRNA-Seq,单细胞参考图谱 - 2023-11-17
Cell:单细胞RNA测序为果蝇神经元分类
大脑的神经系统由成千上万种不同类型的神经细胞构成,这些神经细胞在细胞形态,突触连结及生理功能上具有高度的多样性。不同种类的神经细胞中,其基因组、蛋白组、化学分子组成、代谢也都有着很大的差别。因此,对脑内神经细胞进行分类,以更好地理解其分子特性及生理功能十分重要。
生物探索 - RNA测序,脑神经,神经元 - 2017-11-17
基于RNA-Seq的长非编码RNA(lncRNA)预测
随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用 当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq,长非编码RNA - 2014-01-03
RNA-seq方法原理、数据分析、数据库及工具全面介绍
bsp;- De novo assembly of short reads with robust error correction. An improvement on early versions of SSAKE. * Velvet - Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for sho
MedSci原创 - RNA-Seq,数据,数据库 - 2014-01-04
RNA-seq技术揭示与前列腺癌有关的新型融合基因
973首席科学家第二军医大学上海长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究,发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。研究
MedSci原创 - 前列腺癌,融合基因 - 2012-03-21
单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法
TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法,可以把少量RNA(最少到1个细胞,约10pg)扩增到ng级,以达到可以进行高通量测序所需的核酸量cDNA:RNA杂交产物中的RNA被RNase
陈巍学基因 - 单细胞测序,SMART - 2014-04-06
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