Cell Stem Cell丨同济康九红组揭示非编码RNA调控心肌分化和心脏发育过程的表观遗传机制
哺乳动物的心脏发育是一个多阶段且受到严格调控的复杂过程，受到多种转录因子、染色质调控分子和信号分子在不同时间和空间上的共同精确控制，倘若此过程中的基因调控网络受到影响或中断都将导致心脏疾病的发生。因此，深入了解心肌分化和心脏发育过程中转录调节网络至关重要。胚胎干细胞作为一类能够在体外培养且具有完整发育全能性的细胞，是解析细胞命运决定和个体发育机制的重要工具。基于成熟的心肌细胞体外定向分化技术，使得
BioArt - 非编码，RNA，调控，心肌分化，心脏发育过程，表观遗传机制 - 2018-05-16
Biochem Biophys Res Commun：长链非编码RNA——Bmcob可调节骨髓间充质干细胞的成骨细胞分化
骨髓间充质干细胞（BMSCs）的无序成骨细胞分化导致骨质流失，但是其潜在的机制很复杂，目前尚未完全理解。长链非编码RNA（lncRNA）正在成为骨代谢的重要调节因子。在这里，我们发现了一种新的lncRNA，Bmcob，它调节了原代小鼠BMSCs的成骨分化。 在成骨细胞分化期间，Bmcob的表达水平在早期至中期显著上调。Bmcob沉默在体外抑制BMSCs的成骨细胞分化，而其过表达保护BMSCs
MedSci原创 - 2018-11-01
ceRNA（竞争性内源RNA）：国自然基金热点领域
RNA家族，一直是研究热点，从当年的siRNA，miRNA, piRNA，到LncRNA，都是明星。如今又有一些新的名词出现，如ncRNA(lncRNA & circRNA & piRNA) , ceRNA, 其实ceRNA，并不是新的RNA分子，只是一种最新发现的调节机制。ceRNA（competing endogenous RNAs）假说揭示了一
MedSci原创 - 基金，ceRNA，竞争性内源RNA - 2015-12-03
J Clin Invest：长链非编码RNA Bmncr在骨骼衰老过程中调节间充质干细胞的转化
骨髓间充质干细胞（BMSCs）在成骨和成脂命运之间表现出与年龄相关的谱系转换，这有助于骨质流失和肥胖。在这里，我们确定了一种长链非编码RNA，即Bmncr，它在衰老过程中调节BMSCs的命运。Bmncr（Bmncr-KO）缺失的小鼠显示骨量减少和骨髓肥胖增加，而Bmncr（Bmncr-Tg）的转基因过表达减轻了骨丢失和骨髓脂肪积累。Bmncr通过维持细胞外基质蛋白纤维调节素（FMOD）和
MedSci原创 - 2018-11-01
【盘点】非编码RNA与人类疾病关联性亮点研究
人类基因组计划揭示人基因组中有30亿个碱基对，其中1.5%能够编码蛋白质，98.5%是非蛋白质编码基因，这些基因序列一度被认为是垃圾基因。然而随后的ENCODE计划表明，大约75%的人类基因组能被转录成RNAs，当中74%是非蛋白编码RNA（ncRNAs）。随着基因组学和生物信息学的发展，尤其是高通量测序技术的大量应用，科学家发现了越来越多的非蛋白编码的转录单元（即非编码RNA，ncRNAs），
生物谷 - 非编码RNA，CRISPR，lncRNA - 2015-08-21
Stem cells：长链非编码RNA RP11-380D23.2通过调控PITX2表达影响肺的末梢-近端模式。
早期的肺发育是一个惊喜策划的过程，包括终末内胚层的形成、终末内胚层的内向化，以及随后的近端和末梢肺前体细胞的分化和成熟。现已有数篇报道详细介绍在肺发育过程中相互作用的基因和蛋白，但尚没有关于长链非编码RNAs（lncRNAz）在肺发生过程中的作用的文章。Poulomi Banerjee等人将人源性诱导的多能干细胞诱导分化成末梢和近端肺前体细胞来模拟活体内肺发育。通过检测肺关键标志物（如FoxA2、
MedSci原创 - 肺发育，RP11-380D23.2，长链非编码RNA - 2017-12-04
Stem Cells Dev：miRNA-376c-3p或可用于处理颅骨细胞的异常骨形成
激活或抑制主基因调节因子和信号通路的关键转录因子与调节骨髓基质细胞（BMSC）的自我更新和细胞谱系分化关系密切。这些因子中包括碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）转录因子Twist相关蛋白1（TWIST-1），在BMSC自我更新、寿命和分化中十分重要。另一层基因调控来自MicroRNA（miRNA）。miRNA是短链非编码RNA，干扰特定靶mRNA的翻译，从而调节多种生物过程，包括BMSC谱系定型。然而
MedSci原创 - 2018-09-21
Mol Cell Biol：研究揭示营养匮乏的肿瘤微环境中癌细胞生长的机制
长链非编码RNAs在肿瘤进展中发挥了重要的作用，但是在处于营养匮乏的肿瘤微环境中肿瘤细胞中的作用尚不清楚。本研究中，研究人员发现了一种营养饥饿反应的长链非编码RNA，JHDM1D反义1（JHDM1D-AS1），通过调节响应营养饥饿的血管生成而促进肿瘤的发生发展。癌细胞中JHDM1D-AS1的表达增加。此外，临床肿瘤样本中JHDM1D-AS1的表达较正常组织高。体外研究发现，人胰腺癌细胞（(PANC
MedSci原创 - 2017-09-08
【盘点】LncRNA近期重要研究进展一览
长链非编码RNAs（lncRNAs）是一类非编码RNA转录本，它们的长度超过200个核苷酸，并且不太保守。到目前为止，只有几条功能性lncRNA已经得到很好的表征，据证明它们在多种细胞过程中起重要的调控作用。鉴于lncRNA功能的确切机制仍有待于发现，一种被广泛提出的模型是，对于其他调控蛋白来说，lncRNAs可能发挥信号、诱饵、指导或支架的作用。这里梅斯小编整理了近期关于lncRNAs的重要研究
MedSci原创 - lncRNA - 2017-10-03
Biosci Rep：lncRNA ILF3-AS1或是黑素瘤的潜在预后生物标志物和治疗靶标
黑色素瘤是恶性程度最高的皮肤癌，是导致皮肤癌相关死亡的主要原因。长链非编码RNA（lncRNA）是一类在许多癌症中起关键作用的非编码RNAs。然而，lncRNAs在黑色素瘤中的作用目前仍知之甚少。本研究中，研究人员利用公开发表的数据和临床组织样本，发现lncRNA ILF3-AS1在黑色素瘤组织和细胞系中表达上调，并与黑色素瘤患者的预后不良相关。功能实验显示ILF3-AS1的敲低可抑制黑色素瘤细胞
MedSci原创 - LF3-AS1，黑素瘤，生物标志物 - 2017-11-09
Sci Rep：研究表明lncRNAs或可有助于肌炎的治疗
肌炎的特征是肌肉发炎和无力。虽然一般认为肌炎是由全身自身免疫反应所引发的，但是越来越多的证据表明，肌肉的内在变化也可能参与了肌炎的发病机制。长链非编码RNAs（lncRNAs）是一个新的家庭基因，参与调节基因的转录和翻译。为了确定lncRNAs的潜在作用，研究人员们采用新一代测序以探究肌炎及抗JO1相关肌炎（Jo-1）组织中转录组的表达差异。结果显示，Jo-1和IBM患者肌肉组织中分别有1287个
MedSci原创 - lncRNAs，肌炎 - 2017-09-04
非编码RNA——疾病的调控因子
摘要 50年来，人们对于基因的概念仅仅局限于基因组的mRNA编码区域。然而最新的基因组学研究改变了这种传统的观念，人们开始认识到人类基因组存在着广泛转 录的现象，能够产生成千上万种起调控作用的非编码RNA（ncRNA，non-protein-coding RNA），这其中包括microRNAs，小干扰RNAs（small interfering RNAs），P
MedSci原创 - 非编码RNA，疾病 - 2014-01-03
竞争性内源RNA（ceRNA）数据库资源集锦
ceRNA（competing endogenous RNAs，竞争性内源RNA）假说揭示了一种RNA间相互作用的新机制。已知microRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默，而ceRNA可以通过竞争性地结合microRNA来调节基因表达。ceRNA可以通过应答元件（microRNA response elements，MREs)与microRNA结合从而影响microRNA导致的基因沉默，这
MedSci原创 - ceRNA，数据库 - 2015-12-03
Exp Mol Pathol：LncRNA KCNQ1OT1通过海绵miRNA-214促进BMP2表达以调节成骨分化
骨髓间充质干细胞（BMSCs）的成骨分化对于骨形成具有重要意义，其不平衡会导致骨质疏松症和其他病理性骨缺损。越来越多的证据表明，长链非编码RNA（lncRNA）和miRNA在成骨分化的调节中起着至关重要的作用。LncRNA KCNQ1OT1通常被认为是印迹lncRNA并且与肿瘤进展相关，而其在成骨分化中的功能仍不清楚。进行qRT-PCR以检测KCNQ1OT1，miR-214和成骨相关基因BMP2，
MedSci原创 - 2019-02-01
带你全面认识长链非编码RNA(lncRNA)
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，它们并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。lncRNA 起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因 组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内
MedSci原创 - 长链非编码RNA，RNA - 2014-01-03
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