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Genome Biology综述:大型细胞图谱带来的洞见、机遇与挑战

Genome Biology综述:大型细胞图谱带来的洞见、机遇与挑战

本研究重点回顾了迄今为止单细胞图谱研究的主要成果、尚需进一步发展的领域,以及需要克服的具体挑战。

测序中国 - 细胞图谱 - 2025-11-05

Nature Methods:江瑞教授团队提出国际上首个单细胞表观基因组基础大模型EpiAgent

Nature Methods:江瑞教授团队提出国际上首个单细胞表观基因组基础大模型EpiAgent

清华江瑞团队提出国际首个单细胞表观基因组大模型 EpiAgent,以 14 亿参数将染色质开放区域压缩为 “细胞语句”,可解决多分析任务,还实现调控元件虚拟敲除。

测序中国 - 单细胞表观基因组,EpiAgent - 2025-09-27

Nature Methods:数据共享与更新:单细胞图谱如何‘活’起来?

Nature Methods:数据共享与更新:单细胞图谱如何‘活’起来?

本文介绍单细胞测序技术发展背景下构建单细胞参考图谱的重要性,阐述构建图谱的关键步骤(包括目标明确、数据挑选与把控等)、克服批次效应的方法,以及图谱在医学研究、共享更新等方面的作用与意义。

生物探索 - 单细胞测序技术,单细胞参考图谱 - 2024-12-18

IF=52.7! 北京协和医学院,最新STTT,食管癌免疫治疗预测!

IF=52.7! 北京协和医学院,最新STTT,食管癌免疫治疗预测!

本研究提供了ESCC肿瘤微环境的全面免疫图谱,揭示了关键的免疫缺陷和针对性干预的机会。这些发现强调了根据TME的特定免疫特征量身定制免疫治疗的潜力。

BioMed科技 - 食管癌,免疫治疗 - 2025-10-22

Nature:2024年值得关注的七大技术

Nature:2024年值得关注的七大技术

2024年1月22日,《自然》发布了2024年值得关注的七大技术——

MedSci原创 - 人工智能,脑机接口,生物技术,3D打印机,基因编辑,人类细胞图谱,蛋白质设计,超高分辨率显微成像 - 2024-01-28

Nat Commun:北大高歌团队开发新型深度学习模型DECIPHER,破解细胞分子与空间背景“纠缠”难题

Nat Commun:北大高歌团队开发新型深度学习模型DECIPHER,破解细胞分子与空间背景“纠缠”难题

DECIPHER 模型以双编码器解耦空间组学中细胞分子与空间信息,跨尺度对比学习优化,优于主流方法,可处理百万级细胞数据,精准识别定位相关基因 / LR 对,支持 3D 分析。

测序中国 - 空间组学,DECIPHER - 2025-09-01

Nat Commun:蒋庆华/徐江平/孙皓修团队绘制人类大脑皮层单细胞空间转录组图谱,高分辨率解析神经细胞空间分布及功能关联

Nat Commun:蒋庆华/徐江平/孙皓修团队绘制人类大脑皮层单细胞空间转录组图谱,高分辨率解析神经细胞空间分布及功能关联

该研究为人类大脑皮层中复杂和智能区域的细胞基础提供了见解。

测序中国 - 单细胞图谱,空间转录组 - 2025-08-23

Nature Methods:解锁生命的地图:人体图谱带来的科学革命

Nature Methods:解锁生命的地图:人体图谱带来的科学革命

本文介绍人体图谱项目的发展、相关技术、揭示的奥秘、面临的数据整合挑战,以及在疾病诊断、药物开发、个性化医疗等方面的应用前景和未来发展方向。

生物探索 - 细胞功能,人体图谱 - 2024-12-13

告别 “估摸着吃”!115 种食品数字化图谱问世,9 大类食物含小中大三种份量

告别 “估摸着吃”!115 种食品数字化图谱问世,9 大类食物含小中大三种份量

本文介绍了首个针对中亚地区的数字视觉食品图谱,支持精准饮食评估与营养研究。

MedSci原创 - 人工智能,营养评估 - 2025-10-24

首次报道:亚洲髓母细胞瘤4种亚型的胚系变异谱和染色体拷贝数变异,为潜在精准治疗提供依据

首次报道:亚洲髓母细胞瘤4种亚型的胚系变异谱和染色体拷贝数变异,为潜在精准治疗提供依据

本研究为了解亚洲队列中髓母细胞瘤的基因图谱提供了宝贵见解,强调了人群特异性研究的重要性。研究鉴定出的基于亚型的胚系变异图谱。

绘真医讯 - 髓母细胞瘤 - 2025-09-23

Nature Medicine观点文章 | 人类细胞图谱对医学的影响

Nature Medicine观点文章 | 人类细胞图谱对医学的影响

单细胞和空间图谱的不断发展,改变了我们在细胞和组织水平上对不同疾病的理解,并为诊断学、药物发现和新治疗途径的发展提供了信息。

测序中国 - 从疾病相关基因到作用细胞,重塑疾病组织中的细胞,绘制肿瘤中恶性细胞和微环境细胞 - 2023-01-23

Nature Methods:细胞形态学图谱:解锁基因功能的新钥匙

Nature Methods:细胞形态学图谱:解锁基因功能的新钥匙

通过整合光学成像和高通量数据分析,该研究为探索基因与细胞功能的关系提供了一种具有成本效益且易于扩展的方法。这种创新技术不仅突破了传统分析方法的限制,还为未来在不同生理和疾病背景下的深入研究奠定了基础。

生物探索 - 基因功能,细胞形态学图谱 - 2025-01-29

Genome Biol:曹亚南/孙洁林团队开发知识图谱增强框架KEGNI推断基因调控网络

Genome Biol:曹亚南/孙洁林团队开发知识图谱增强框架KEGNI推断基因调控网络

上海交大医学院附属瑞金医院与上海交大团队开发KEGNI方法,整合先验知识与scRNA-seq数据推断细胞类型特异的GRN,通过MAE和KGE模块提升准确性与可解释性,识别驱动基因,应用前景广。

测序中国 - 基因调控网络,KEGNI - 2025-09-26

重磅|浙大、北大、华大团队联合发表单细胞及空间组学大综述

重磅|浙大、北大、华大团队联合发表单细胞及空间组学大综述

该综述以超长篇幅(近3万字,700多篇文献)系统性梳理了单细胞和空间基因组学领域的历史、进展、应用与展望。

iNature - 单细胞,空间基因组学 - 2025-01-06

预测非小细胞肺癌免疫治疗疗效生物标志物的研究前沿与热点分析

预测非小细胞肺癌免疫治疗疗效生物标志物的研究前沿与热点分析

本研究通过CiteSpace对预测NSCLC免疫治疗疗效的生物标志物研究领域的热点及趋势进行可视化分析,希望为国内学者的研究提供参考。

中国胸心血管外科临床杂志 - 非小细胞肺癌,免疫治疗 - 2025-10-19

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