Science：中国科学家领衔“破译”绵羊基因组
2014-06-08 林小春 新华网
由中国科学家领衔的一个国际科研小组５日宣布，历经５年时间，他们完成了对绵羊基因组的测序、组装及分析工作。这项成果使人们对反刍动物生物学有了崭新认识。更重要的是，中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国，新研究将促进选育出更优秀的肉羊新品种。绵羊基因组的测序工作在２００９年正式启动，其中中国科学院昆明动物研究所与华大基因联合测序一头母羊，而英国罗斯林研究所测序一头公羊，参考基因组序列在２０１２年对外正式发
由中国科学家领衔的一个国际科研小组５日宣布，历经５年时间，他们完成了对绵羊基因组的测序、组装及分析工作。这项成果使人们对反刍动物生物学有了崭新认识。更重要的是，中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国，新研究将促进选育出更优秀的肉羊新品种。
绵羊基因组的测序工作在２００９年正式启动，其中中国科学院昆明动物研究所与华大基因联合测序一头母羊，而英国罗斯林研究所测序一头公羊，参考基因组序列在２０１２年对外正式发布。
此后，昆明动物研究所、西北农林科技大学、华大基因、澳大利亚联邦科学与工业研究组织、英国罗斯林研究所、法国国家农业研究院、美国犹他州立大学等２６家单位联合对绵羊基因组进行分析，最新成果５日发表在美国《科学》杂志上。
最新分析表明，绵羊染色体上有１４１个大结构改变、近１万个拷贝数变异（即片段缺失或片段复制异常）、约１０００万个单核苷酸多态性变异。此外，新研究还鉴定出一系列反刍动物特有的基因家族扩张事件、基因结构变异和基因表达的组织特异性变化，其中最重要的是发现了反刍动物独特的消化系统和脂类代谢进化相关联的特异基因。
研究第一作者、西北农林科技大学姜雨副教授告诉新华社记者，绵羊是反刍动物的一个典型代表动物，而瘤胃是反刍动物独有的消化器官，可以有效地将植物纤维转化为挥发性脂肪酸。他们首次发现两种在绵羊中发生特异蛋白结构改变、且仅在瘤胃中特异高表达的结构蛋白，一种是被首次发现并命名的毛透明蛋白类似蛋白，另外一种是小脯氨酸丰富蛋白Ⅱ家族。
此外，除了肝脏，反刍动物的皮肤也是重要的脂类代谢器官。姜雨说，他们在绵羊皮肤中找到了控制脂类合成的关键基因ＭＯＧＡＴ２和ＭＯＧＡＴ３。
姜雨说，“绵羊参考基因组的发布和分析，使我们对反刍动物生物学有了崭新认识”，并初步了解了“反刍动物成为最繁盛的陆地食草动物的原因”。
他说，更重要的是，中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国，这一研究有助于培育出更优秀的专门化肉羊新品种。
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#中国科学#
28
#SCIE#
22
#中国科学家#
23
中国高级民工花五年时光将养系基因拼到一起，发哦了一文，下一步看他人引用
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记者在这里报道新闻时，把文章省略到只有三句话，还要通俗易懂，结果给大家感觉没什么内容，此外这句话应该是“绵羊皮肤中表达控制脂类合成的关键基因”。
如果想综合评价文章，还是请看看我们文章的正文，还有89页的附件，其中19页方法和没有版面放到正文里的text，以及33个附图和27个附表，有表达量分析，pcr验证，原位杂交等等实验和数据比对模拟。每篇基因组文章会有大量灌水图表，不过这次的文章灌水比例已经是最低的了。能只通过一个基因组找到这么多可信的点，去除测序的一年时间，分析前前后后花费了四年时间。很多有意思的结果，因为相对不重要最终放到附件Supplementary text中，比如我们第一次发现瘤胃作为发酵微生物的容器，却大量表达溶菌酶；找到绵羊x染色体出现新的着丝粒，且恰巧出现在伪常染色体的边界；找到绵羊中大量的单等位基因表达现象等等。
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鄙视测序的飘过。。。
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