Sci Rep:基于LC-MS的肾细胞肿瘤组织学亚型代谢组学分析

2019-11-14 AlexYang MedSci原创

肾细胞肿瘤(RCC)是根据他们的组织学特性进行分类的。RCC准确的分类和代谢异常的综合理解具有非常重要的意义。最近,有研究人员调查了使用代谢组学分析对主要的RCC亚型进行分类情况,并描述了每一种亚型的代谢变异情况。研究人员使用液相色谱-质谱法对65个RCC冷冻样本进行了代谢组学分析(40个透明细胞癌,14个乳头状癌和11个嫌色性细胞癌)。基于代谢组数据的OPLS-DA多变量分析表明了3种RCC主要

肾细胞肿瘤(RCC)是根据他们的组织学特性进行分类的。RCC准确的分类和代谢异常的综合理解具有非常重要的意义。

最近,有研究人员调查了使用代谢组学分析对主要的RCC亚型进行分类情况,并描述了每一种亚型的代谢变异情况。研究人员使用液相色谱-质谱法对65个RCC冷冻样本进行了代谢组学分析(40个透明细胞癌,14个乳头状癌和11个嫌色性细胞癌)。基于代谢组数据的OPLS-DA多变量分析表明了3种RCC主要亚型明显的区别(R2=75.0%, Q2=59.7%)。研究人员通过一个独立的群体对预后表现进行了评估,透明细胞癌,乳头状细胞癌和嫌色性细胞癌的AUROC分别为0.924, 0.991和1。21种顶级代谢物的进一步途径分析表明氨基酸和脂肪酸代谢在3种RCC亚型之间存在显著差异。

最后,研究人员指出,他们的研究表明了代谢组情况可以作为RCC组织学亚型分析的一种补充工具。另外,研究人员确立了RCC亚型中的代谢异常总的情况,对于临床行为的理解以及靶向治疗策略的开发提供了新的认知。

原始出处:

Lun Jing, Jean-Marie Guigonis, Delphine Borchiellini et al. LC-MS based metabolomic profiling for renal cell carcinoma histologic subtypes. Sci Rep. 30 Oct 2019

本文系梅斯医学(MedSci)原创编译整理,转载需授权!

相关资讯

Nat Commun:透明细胞肾细胞肿瘤中克隆结构能够预测临床结果

透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的遗传背景已经具有大量的调查,但是其进化模式仍旧不清楚。最近,有研究人员从3个不同的群体中分析了473名患者的克隆结构特性。研究发现,突变特征在不同的群体和进化阶段不同。ccRCC的进化模式具有很大的患者之间的遗传异质性,其中del(3p)被认为是常见的最早的事件,之后是3个早期的起始点:VHL和PBRM1变异、del(14q)和其他的体细胞拷贝数变化(SCNAs),

Sci Rep:在肾细胞肿瘤中,癌症干细胞标记OCT4和NANOG的共表达能够预测不良预后

许多肾癌患者在组合治疗或者免疫治疗后由于癌症干细胞(CSCs)的存在都要经历疾病的复发。最近,有研究人员在肾细胞肿瘤中评估了OCT4和NANOG在表达模式和临床意义,它们均为肾细胞肿瘤的关键干细胞因子。研究总共包括了186个RCC组织样本,并利用工人的CSC标记OCT4和NANOG进行组织芯片免疫染色。之后,研究人员确定了这些标记的表达、临床病理学变量和生存结果之间的相关性。研究发现,OCT4和N