Cell Discovery:中山大学骆观正团队首次发现哺乳动物基因组中罕见的6mA是由RNA m6A机制通过非靶向机制引入的
2022-12-30 iNature iNature 发表于上海
该研究证实了基于双链体DNA的N6 -脱氧腺苷促进了一种错配样结构,可能是通过DNA呼吸或碱基翻转机制。
N6-脱氧腺苷甲基化(6mA)是原核生物中最广泛的DNA修饰类型,也大量分布在单细胞真核生物中。然而,哺乳动物体内的6mA含量非常低。由于缺乏精确和全面的测绘方法,阻碍了对6mA进行更深入的研究。
2022年12月27日,中山大学骆观正团队在Cell Discovery在线发表题为“High-precision mapping reveals rare N6-deoxyadenosine methylation in the mammalian genome”的研究论文,该研究通过高精度图谱揭示了哺乳动物基因组中罕见的N6-脱氧腺苷甲基化。该研究报道了一种基于新检测原理的全基因组6mA映射新方法MM-seq(修饰诱导错配测序)。该研究发现修饰后的DNA碱基容易形成一个局部开放区域,允许抗体捕获。特定的内切酶或外切酶可以识别抗体稳定的错配样结构,并标记准确的修饰位点,以便测序读出。
利用这种方法,该研究检测了6mA在细菌(大肠杆菌)、绿藻和哺乳动物细胞(HEK239T、Huh7和HeLa细胞)中的基因组位置。与细菌和绿藻相比,人类细胞拥有非常有限的6mA位点,它们零星分布在不同细胞类型的基因组中。在敲除小鼠ES细胞中的RNA m6A甲基转移酶METTL3后,6mA大部分减少。总之,该研究结果表明哺乳动物基因组中罕见的6mA是由RNA m6A机制通过非靶向机制引入的。
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