CCLM：miRNA，SNPs和年龄相关性黄斑变性（AMD）之间关系如何？
2017-05-18 MedSci MedSci原创
高龄年龄相关性黄斑变性（AAMD）是一项危害公众的复杂视力亢进疾病。前期研究认为miRNA可作为AAMD的标志物。某些单核苷酸多态性（SNPs）的存在可能影响这些生物标志物的解释价值。在本研究中，研究人员提出了一种综合方法，用于确定AAMD相关SNP是否具有影响miRNA-mRNA配对的能力。
高龄年龄相关性黄斑变性（AAMD）是神经和血管视网膜复杂的慢性视力威胁性疾病,也是欧洲老年人不可逆转的视力丧失的主要原因。近日，国际杂志Clinical Chemistry and
Laboratory Medicine上在线发表一项关于miRNA，单核苷酸多态性（SNPs）和年龄相关性黄斑变性（AMD）之间关系的研究。
高龄年龄相关性黄斑变性（AAMD）是一项危害公众的复杂视力亢进疾病。前期研究认为miRNA可作为AAMD的标志物。某些单核苷酸多态性（SNPs）的存在可能影响这些生物标志物的解释价值。在本研究中，研究人员提出了一种综合方法，用于确定AAMD相关SNP是否具有影响miRNA-mRNA配对的能力。
研究人员通过分析与3万名老年人队列中p值≤5.0E-7的AAMD相关的8854个SNP，鉴定了miRNA靶标编码成分中的SNP：（1）补体激活（RCA）基因调控rs390679，CFHR1，p≤2.14E-214 | rs12140421，CFHR3， p≤4.63E-29）; （2）主要组织相容性复合体（MHC）基因座（rs4151672，CFB，p≤8.91E-41 | rs115404146，HLA-C，p≤6.32E-12 | rs1055821，HLA-B，p≤1.93E-9 | rs1063355，HLA-DQB1，p≤6.82E-14）; 和（3）10q26AAMD基因座的基因（rs1045216，PLEKHA1，p≤4.17E-142 | rs2672603，ARMS2，p≤7.14E-46）。通过使用这些发现与AAMD相关的视网膜miRNA和转录物谱的现有数据，以推断SNP-mRNA-miRNA-AAMD关系。AAMD视网膜中12个miRNA中的4个（hsa-miR-155-5p，hsa-let-7a-5p，hsa-let-7b-5p, hsa-let-7d-5p）显著升高也显示出与HLA-DQB1（rs1063355，hsa-miR-155-5p）和TGFBR1（rs868，hsa-let-7）中的AAMD相关SNP编码的miRNA靶转录物强配对能力。在AAMD视网膜中过表达的12种miRNA中的3种可被NFkB诱导，并且在补体因子H（CFH）mRNA 3'UTR中具有高亲和力靶标。此外，研究人员使用ENSEMBL鉴定CFH mRNA 3'UTR中的多态性区域，具有破坏miRNA-mRNA配对的能力。存在于编码CFH mRNA 3'UTR中hsa-miR-146a-5p的种子区域的DNA序列中的两个突变体（rs766666504和rs459598），因为该miRNA在AAMD患者中的玻璃体和血清中也出现升高，作为标志物显示出很好的价值。
研究结果表明，miRNA标志物作为对于AMD的预后效用能够被编码miRNA-mRNA配对位点的基因组区域中DNA序列变异改变，关于这种突变体对miRNA靶标或结合强度的改变的知识有助于提高对miRNAs标志物在AAMD中的潜在应用。
原始出处：
John Paul SanGiovanni, Peter M. SanGiovanni, Przemysław Sapieha,
et.al. miRNAs, single nucleotide polymorphisms (SNPs) and age-related macular
degeneration (AMD).
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