Sci Rep：吸烟与COPD烟雾暴露小鼠肺组织转录组的比较
2018-08-11 MedSci MedSci原创
人和动物模型的肺组织中全基因组mRNA谱可以提供对慢性阻塞性肺病（COPD）的发病机理的新见解。虽然广泛使用6个月的烟雾暴露，但也报告了较短的持续时间。目前尚未充分了解小鼠短期和长期烟雾暴露的重叠，并且它们对人类的影响尚不确定。从GEO获得六个鼠吸烟实验（n = 48）的肺组织基因表达谱，并分析以鉴定鼠吸烟特征。含有386个基因的“人类吸烟”基因标签先前已在肺eQTL研究中发表（n = 1,111
人和动物模型的肺组织中全基因组mRNA谱可以提供对慢性阻塞性肺病（COPD）的发病机理的新见解。虽然广泛使用6个月的烟雾暴露，但也报告了较短的持续时间。目前尚未充分了解小鼠短期和长期烟雾暴露的重叠，并且它们对人类的影响尚不确定。
从GEO获得六个鼠吸烟实验（n = 48）的肺组织基因表达谱，并分析以鉴定鼠吸烟特征。含有386个基因的“人类吸烟”基因标签先前已在肺eQTL研究中发表（n = 1,111）。在同一研究中也鉴定出含有7种基因的轻度COPD的特征。 “严重COPD”（n = 70）的肺组织基因特征包含4,071个基因并且之前已发表。
我们在6个月暴露小鼠数据集中检测到3,723个差异表达的基因（FDR <0.1）。其中，184个基因（占人类吸烟的48％）和1,003个（占人类COPD的27％）分别与人类吸烟相关基因和COPD严重程度相关基因相同。人和小鼠吸烟相关基因的过度表现有4倍（P = 6.7×10-26），在严重的COPD相关基因中有1.4倍（P = 2.3×10-12）。在轻度COPD特征中，小鼠和人类吸烟相关基因没有显着富集。
这些数据表明小鼠烟雾模型可代表人类吸烟的分子过程，但较少代表COPD。
原始出处：
Obeidat M, Dvorkin-Gheva A, et al., The Overlap of Lung Tissue Transcriptome of Smoke Exposed Mice with Human Smoking and COPD. Sci Rep. 2018 Aug 8;8(1):11881. doi: 10.1038/s41598-018-30313-z.
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