JAMA Oncology：MUC16突变与更高的肿瘤突变量和更好的胃癌生存相关
2018-08-19 肿瘤资讯编辑部 肿瘤资讯
胃癌是一类基因异质性较大的疾病，肿瘤突变量（TMLs）存在显著差异。MUC16是胃癌中最常见的突变基因，但其与TML和患者预后的关系尚未明确。来自天津肿瘤医院的研究团队分别在TCGA胃癌队列和亚洲胃癌队列中独立验证了MUC16突变与胃癌突变量和患者生存的关系，并于近期发布在JAMA Oncology杂志上。
胃癌是一类基因异质性较大的疾病，肿瘤突变量（TMLs）存在显著差异。MUC16是胃癌中最常见的突变基因，但其与TML和患者预后的关系尚未明确。来自天津肿瘤医院的研究团队分别在TCGA胃癌队列和亚洲胃癌队列中独立验证了MUC16突变与胃癌突变量和患者生存的关系，并于近期发布在JAMA Oncology杂志上。
背景
胃腺癌是全球癌症病死率最高的肿瘤之一。尽管在HP根除和早期筛查上取得进展，但全球胃癌的5年生存率仅为29.6%。胃癌是一类基因异质性较大的疾病，肿瘤突变量（TMLs）存在显著差异。近期的研究显示，MSI-H或POLE突变的胃癌样本表现为DNA错配修复缺陷（MMR）和高的TMLs。在TCGA关于胃癌的分子亚型分类中，肿瘤突变量是重要的决定因素。在TCGA胃癌样本中，划分了4个不同的分子亚型，每个分子亚型的患者都有不同的基因特征。既往研究发现，胃癌的克隆复杂性和驱动突变模式与生存相关。近期研究显示，MMR缺陷的肿瘤，无论其组织学来源，均对免疫治疗敏感。MUC16是胃癌中最常见的突变基因，但其与TML和患者预后的关系尚未明确。本研究探索了MUC16突变与TML的关系，以及其是否影响胃癌患者的预后。
方法
研究从TCGA数据库中获取了437例胃癌患者的体细胞突变和基因表达数据；亚洲队列患者的临床和特细胞突变数据从既往的研究中获取。亚洲队列中包含256例胃癌患者，其中78例来自中国北方、100例来自香港、49例来自南韩、30例来自韩国。亚洲队列的基因表达数据未可及。肿瘤突变量定义为log2（每百兆碱基突变率）。
结果
TCGA队列
在437例胃癌患者中，280例（64.1%）为男性，中位年龄为67.6岁。TCGA队列中，最常见的突变基因之一为MUC16，突变率为38.4%（168/437）。合并MUC16突变的患者相比于无MUC16突变的患者，TMLs更高，见图1A。在MUC16突变的患者中，73例患者同时合并与维持基因完整性、DNA复制和MMR相关的基因突变，如BRCA1/2、POLE和MLH3，见图1B。MUC16和其家族成员之间的突变相关性总结见图1B。
图1. TCGA队列中，Mucin基因家族突变模式与基因不稳定相关基因突变的关系
MUC16突变与TML的关系
MUC16突变的胃癌样本具有更高的突变率，见图2A。治疗突变量主要与基因不稳定性相关，其在胃癌中很常见。在这些样本中，研究者发现了6个突变特征，包括与基因不稳定相关基因。在分析MUC16突变和TML关系时，研究者采用多因素模型，排除了潜在的混杂因素。在多因素分析中，MUC16突变和TML显著显著相关（OR 1.87，P<0.001），图3A。
TCGA队列患者的生存
在TCGA队列中，MUC16突变与更好的生存显著相关（mOS 46.9 vs 26.7，P=0.007）。在校正了年龄、性别、TNM分期、BRCA1/2和POLE突变以及dMMR后，仍存在显著差异，HR 0.61（95%CI：0.42-0.89），P=0.01，图3B。
图2. TCGA队列中，MUC16突变和TML及预后的关系
图3. TCGA队列中，MUC16突变与更高的TML和更好的预后相关
亚洲队列中，独立验证MUC16突变
亚洲队列中纳入256例患者，其中141例为男性，中位年龄为63岁。MUC16突变在亚洲人群中突变率为22.3%。在MUC16突变的胃癌患者中，观察到显著更高的突变数（134 vs 74，P<0.001）。与TCGA队列相似，MUC16突变的胃癌患者，相比于无突变的患者，有显著更高的TML（2.1 vs 1.2，P<0.001），见图4A。MUC16突变与更高TML的相关性在调整年龄、性别、TNM分期、突变特征和BCA1/2突变，POLE突变的多因素模型中，仍存在显著统计学意义（OR 1.69；95%CI：1.25-2.29；P<0.001），见图5A。在生存分析中，MUC16突变与更好的预后显著相关，见图4B，mOS分别为尚未达到 vs 36.8个月，P=0.04；在调整了年龄、性别、TNM分期和突变特征后，差异仍有显著统计学意义（HR 0.26；95%CI：0.07-1.02；P=0.05），见图5B。
图4. 亚洲队列中，MUC16突变和TML及预后的关系
图5. 亚洲队列中，MUC16突变与TML和生存的关系
结论和讨论
在TCGA和亚洲队列这2个独立的基因数据库中，研究发现MUC16突变和更高的TML相关，也与胃癌患者更好的预后相关。这一结果有助于判断胃癌患者的预后，并指导临床治疗。
原始出处：
Xiangchun Li, Boris Pasche, Wei Zhang, et al. Association of MUC16 Mutation With Tumor Mutation Load and Outcomes in Patients With Gastric Cancer. JAMA Oncology. Aug 2018.
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