FDA批准Invitae常见遗传性癌症Panel上市,可基于血液DNA评估数十种癌症易感性

2023-10-12 测序中国 测序中国 发表于上海

该常见遗传性癌症Panel是一种高通量体外诊断检测,可以检测血液DNA中数百种与患某些癌症风险增加有关的遗传变异,还可以识别已确诊癌症个体中潜在的癌症相关遗传变异。

近日,美国FDA以De Novo形式批准了Invitae的基因检测“常见遗传性癌症Panel(Common Hereditary cancer Panel)”的上市许可。该常见遗传性癌症Panel是一种高通量体外诊断检测,可以检测血液DNA中数百种与患某些癌症风险增加有关的遗传变异,还可以识别已确诊癌症个体中潜在的癌症相关遗传变异

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据悉,Invitae常见遗传性癌症Panel是同类检测方法中首个获得FDA上市许可的,可对血液样本中提取的DNA进行评估,以检测47种已知与患某些癌症风险增加相关基因中的替换、小片段插入和缺失变异( Indel)以及拷贝数变异(CNV)。

虽然对癌症相关遗传变异的检测对诊断行业来说并不是什么新鲜事,但Invitae公司提供的检测规模已经定义了一个新的产品类别。FDA根据De Novo程序(一种新型低至中等风险医疗器械的监管途径)审查了Invitae的常见遗传性癌症Panel。

FDA设备和放射健康中心主任Jeff Shuren博士表示:“这种检测可以通过NGS在一次检测中评估多个基因,已被证明有助于敏感和快速的深入了解遗传变异。此次批准可以提供一个重要的公共卫生工具,为个人提供更多关于他们健康的信息,包括某些癌症的易感性,这可以帮助指导医生根据发现的基因变异提供适当的监测和潜在的治疗。”

Invitae首席医疗官Robert Nussbaum博士表示:“这对Invitae来说是一个令人兴奋的消息。我们能够证明这项技术可以很好地基于变异类型和基因组背景进行表征,并且在基因之间是一致的,也证明了Invitae的检测质量和严格的验证过程符合FDA的标准。”

据悉,该检测可在护理点(例如医生办公室)收集样本,并送到实验室进行测序。该检测发现的一些最具临床意义的基因包括:遗传性乳腺癌和卵巢癌综合征相关基因BRCA1BRCA2,Lynch综合征相关基因MLH1、MSH2、MSH6、PMS2EPCAM,遗传性弥漫性胃癌和小叶性乳腺癌相关基因CDH1,Peutz-Jeghers综合征相关基因STK11。变异的临床注释是基于已发表的文献、公共数据库、预测程序和Invitae内部的变体数据库,该变异数据库使用Invitae的变异注释标准,与专业组织或认证委员会建立的标准一致。

性能验证结果显示,在9,000多个临床样本中,常见遗传性癌症Panel对检测的所有变异类型的准确率均达到≥99.0%。

与检测相关的风险主要是假阳性和假阴性检测结果,以及对检测结果可能产生的误解。假阴性检测结果可能导致患者得不到适当的监测或临床管理;假阳性检测结果可能导致不适当的医疗保健和生活方式决策,并可能与其他不良临床后果有关。此外,由于该检测并不是为了识别或评估所有已知的癌症易感性相关基因,并且基因变异并不是癌症发展的唯一因素,因此患者有可能误解其检测结果为阴性后仍然有患癌症的风险这一情况。

根据美国疾病控制和预防中心的数据,有超过100多种不同的癌症。Invitae常见遗传性癌症Panel检测可以用作识别各种类型癌症遗传原因的工具。患者需要与医疗保健专业人员(如遗传顾问)讨论任何个人/家族癌症史,因为这些信息将有助于解释检测结果。重要的是,该检测并不旨在识别或评估所有能够提供癌症易感性的已知基因。

随着这项新批准的发布,FDA正在建立定义与标志物和性能检测相关要求的特殊管理。例如,在经过验证的正交方法中,替换、 Indel和CNV报告的准确性必须阳性一致性≥99.0%,阴性一致性≥99.9%。当满足条件时,特殊管理与一般管理相结合,为这类试验的安全性和有效性提供了合理的保证。同时,该批准创建了一个新的监管分类,意味着具有相同预期用途的同类型后续设备可以通过FDA的510(k)上市前流程。该流程可以节省开发人员的时间和费用。

参考资料:

1.FDA Grants First Marketing Authorization for a DNA Test to Assess Predisposition for Dozens of Cancer Types

https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-grants-first-marketing-authorization-dna-test-assess-predisposition-dozens-cancer-types

2.Invitae's Common Hereditary Cancers Panel Receives FDA Market Authorization

https://ir.invitae.com/news-and-events/press-releases/press-release-details/2023/Invitaes-Common-Hereditary-Cancers-Panel-Receives-FDA-Market-Authorization/default.aspx

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