利用IBD精细定位和整合系统生物学鉴别猪2号染色体血脂性状QTL的因果基因及其主效突变位点

负责人:陈从英

依托单位:江西农业大学

批准年份:2011

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项目简介
项目名称
利用IBD精细定位和整合系统生物学鉴别猪2号染色体血脂性状QTL的因果基因及其主效突变位点
项目批准号
31160225
学科分类
C060201 生命科学部 _遗传学与生物信息学 _动物遗传学 _动物分子遗传
资助类型
生命科学
负责人
陈从英
依托单位
江西农业大学
批准年份
2011
起止时间
201201-201512
批准金额
53.00万元
摘要
心血管疾病被称为"人类健康的第一杀手",血脂水平过高是心血管疾病形成的重要原因之一。猪的心血管系统尤其是冠状循环系统在解剖学和血流动力学上与人类非常相近,因此猪是人类心血管疾病研究的理想模式动物。课题组所在实验室利用大规模白色杜洛克×二花脸F2资源群体在2号染色体定位了一个置信区间只有5cM解释7.6%表型方差的显著影响低密度蛋白胆固醇、甘油三酯和总胆固醇的QTL。本项目拟在此基础上,在白色杜洛克×二花脸F2资源群体和杜洛克×二花脸半同胞家系中采用IBD方法精细定位SSC2影响猪低密度蛋白胆固醇、总胆固醇和甘油三酯的QTL,在精细定位的基础上结合肝脏组织eQTL定位、bionetwork和QTT等系统生物学手段分离QTL的因果基因并鉴别其主效突变位点,并进行功能验证。本研究将有助于揭示猪血脂代谢的遗传机理,并以猪作为模式动物,为人类高血脂等心血管疾病的诊断和治疗提供科学借鉴。
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