石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定研究

负责人:姚辉

依托单位:中国医学科学院

批准年份:2010

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项目简介
项目名称
石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定研究
项目批准号
81073001
学科分类
H2802 医学科学部 _中药学 _中药鉴定
资助类型
医学科学
负责人
姚辉
依托单位
中国医学科学院
批准年份
2010
起止时间
201101-201312
批准金额
33.00万元
摘要
以往的DNA条形码序列筛选研究在取样上尺度较大,而对具体类群的研究较少,1个科或1个属只用很少的种类作为代表。DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平,而生物条形码协会建议的植物DNA条形码rbcL和matK序列分子进化速率较慢,在种级水平上分辨率较低。申请者前期研究表明matK序列不能有效鉴定石斛属物种,本研究拟对石斛属叶绿体和核基因DNA条形码候选序列进行综合评价,通过PCR扩增效率,不同序列的测序效率和测序质量,种内/种间遗传距离,种内最大、种间最小遗传距离进行比较,确定种间鉴定的阈值;以Wilcoxon Signed Rank Tests等方法对不同序列在种内和种间的变异性大小统计学检验;对不同序列进行barcoding gap分析,以BLAST等方法评价不同序列的鉴定效率,建立石斛属药用植物DNA条形码复合序列鉴定体系,为石斛属药用植物鉴定、生物多样性和资源保护研究提供依据。
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