项目简介
项目名称
基于蛋白互作网络和基因表达数据的拟南芥成花转变过程分析
项目批准号
31070259
学科分类
C020408
生命科学部
_植物学
_植物生理学
_植物的生长发育
资助类型
生命科学
负责人
张子丁
依托单位
中国农业大学
批准年份
2010
起止时间
201101-201312
批准金额
33.00万元
摘要
研究植物成花转变机理将有助于人们寻找有效控制农作物生长发育的新思路和新手段。当前，大量组学数据的积累为从系统生物学层次研究植物成花转变过程提供了前所未有的机会。本项目将采用生物信息学分析与分子生物学实验相结合的手段，通过整合蛋白互作与基因表达数据，从网络层次研究模式植物拟南芥的成花转变机理，旨在寻找潜在的成花调控基因。首先，我们将开发一个基于密码子对组成信息的拟南芥蛋白互作预测新方法，将其预测结果与已公开发表的实验测定或预测得到的拟南芥互作数据进行有效整合，构建一个较完整的拟南芥蛋白互作网络。然后，我们将拟南芥茎尖分生组织（SAM）在成花转变过程中的基因表达数据整合进已构建的拟南芥蛋白互作网络，鉴定出与植物营养生长或生殖生长相关的网络模块，并通过系统的网络特征分析，再结合分子生物学实验研究寻找新的调控拟南芥成花的基因。本项目的实施还将对开展植物其它生理过程的系统生物学研究具有指导意义。
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