项目简介
项目名称
激酶特异性的蛋白质磷酸化预测方法研究
项目批准号
61101061
学科分类
F010803
信息科学部
_电子学与信息系统
_多媒体通信
_视频传输
资助类型
信息科学
负责人
王明会
依托单位
中国科学技术大学
批准年份
2011
起止时间
201201-201412
批准金额
25.00万元
摘要
蛋白质磷酸化过程是真核细胞生命活动最普遍的调控手段,具有重要的研究意义。发展基于机器学习理论的蛋白质磷酸化预测方法，可以弥补现有实验检测技术中的缺陷，有助于蛋白磷酸化的研究。本课题从以下三个方面改进现有蛋白质磷酸化的预测方法：1）发展专用的机器学习分类方法，扩充现有磷酸化蛋白质数据中所缺乏的蛋白激酶信息，大幅度增加蛋白质磷酸化预测工作的可用数据量；2）收集目前所有已知有助于蛋白质磷酸化预测的生物信息特征加以系统全面地研究；3）引入wrapper、随机森林等新的特征选择技术，将特征选择和蛋白质磷酸化预测紧密结合起来。通过从数据、特征、算法三个角度同时改进现有方法，可以显著提高蛋白质磷酸化预测的性能，并有助于阐明蛋白质磷酸化的生物学机理。在此基础上，构建扩展磷酸化蛋白质和蛋白激酶信息的网络公共数据库和激酶特异性蛋白质磷酸化的在线预测系统，为相关的生物、医学、制药等研究提供理论指导和帮助。
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