项目简介
项目名称
整合多组学数据揭示胚胎干细胞特异的转录调控与染色质状态交联模式
项目批准号
31200997
学科分类
C060703
生命科学部
_遗传学与生物信息学
_生物信息学
_生物信息的整合及信息挖掘
资助类型
生命科学
负责人
肖云
依托单位
哈尔滨医科大学
批准年份
2012
起止时间
201301-201512
批准金额
20.00万元
摘要
理解维持胚胎干细胞（ESC）自我更新及其多潜能性的分子机制成为干细胞治疗的关键。大量研究表明复杂调控网络与表观修饰所刻画的基因染色质状态在维持ESC自我更新及其多潜能性中发挥重要的作用。然而，对ESC特异的调控网络与其染色质状态的协同互作所知甚少。本课题集成与分析新一代测序技术产生的多组学数据，如表观基因组数据（包括组蛋白甲基化、乙酰化、DNA甲基化等）、转录组数据，从系统生物学的角度，基于融合生物学资源与优化策略，系统地识别ESC特异激活的TF和miRNA及其基因的染色质状态。整合TF-gene、TF-miRNA、miRNA-gene与染色质状态构建ESC条件下染色质状态驱动的TF-miRNA-gene复杂调控网络，识别ESC特异激活的TF和miRNA为核心的调控模体，分析调控模体与染色质状态的交联模式，阐明染色质状态如何参与转录调控，揭示维持ESC不断自我更新和多潜能性的分子机制。
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