病源菌诱导油菜基因表达的基因组水平分析

负责人:赵建伟

依托单位:华中农业大学

批准年份:2001

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项目简介
项目名称
病源菌诱导油菜基因表达的基因组水平分析
项目批准号
30170496
学科分类
C0601 生命科学部 _遗传学与生物信息学 _植物遗传学
资助类型
生命科学
负责人
赵建伟
依托单位
华中农业大学
批准年份
2001
起止时间
200201-200412
批准金额
18.00万元
摘要
以抗、感菌核病的甘蓝型油菜品种为材料,建立分离群体,构建分子标记连锁图,定位了6个抗病QTL。用含9千个拟南芥EST的cDNA芯片检测上述抗病材料病原菌诱导基因表达的变化。以接种后32h为时间点,分离处理和对照mRNA,反转录为cDNA后同时与拟南芥芯片杂交。筛选到61个与油菜菌核病局部抗性有关的基因,其中36个有2倍以上的诱导表达,25个的表达被抑制到正常水平的一半以下;46个基因与现有的油菜EST序列的同源性平均为85%。RT-PCR和Northern杂交验证了大部分基因的表达与芯片结果一致。这些基因的功能包括合成与细胞防卫反应有关的蛋白,如几丁质酶、细胞色素P450蛋白、谷胱甘肽S-转移酶、谷胱甘肽合成酶和热激蛋白等;与信号传导有关的蛋白,如凝集素、ACC氧化酶、类似钙调蛋白、类似激酶的跨膜蛋白等; 与转录有关的蛋白如生长素调节蛋白等。还有一些功能未知的基因。通过油菜-拟南芥基因组比较作图,我们将61个差异表达的基因定位在油菜连锁图上,发现8个基因位于油菜菌核病抗性QTL区间内或与其紧密连锁。用拟南芥全基因组芯片检测到了更多的病菌特异性诱导表达的基因。
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