项目简介
项目名称
基于RNA绑定蛋白特异性识别序列的人类长非编码RNA分类研究
项目批准号
31501066
学科分类
C060702
生命科学
_遗传学与生物信息学
_生物信息学
_生物信息算法及工具
资助类型
暂无数据
负责人
孙亮
依托单位
温州医科大学
批准年份
2015
起止时间
201601-201812
批准金额
20.00万元
摘要
长非编码RNA（long-non-coding RNA，lncRNA）是一类数目众多，具有重要生物学功能的RNA分子。当前，大规模的lncRNA陆续被鉴定出来，为推进其深入研究，需要科学的分类注释，并细化分类标准。但是，现有分类标准对于更深入挖掘其生物学功能却没有直接、明确的指导意义。因此，本项目基于人类lncRNA的数据集合，结合国际上已经公开发表的RNA绑定蛋白（RBP）的实验数据，将人类lncRNA与RBP特异性识别序列(motif)的对应关系做为深入研究的基础。结合统计学习理论和启发式搜索算法，以RBP识别motif作为连接lncRNA和已知功能RBP的关键节点，将能够与RBP产生相互作用的人类lncRNA根据不同的RBP类型，进行系统的类别划分和初步的功能验证。本工作的成果，将加速人类lncRNA的研究全面进入到实现生物学功能意义的新阶段。
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