项目简介
项目名称
基于生物信息学方法及RNA-Seq策略探索创伤弧菌sRNA及功能研究
项目批准号
31100960
学科分类
C060703
生命科学部
_遗传学与生物信息学
_生物信息学
_生物信息的整合及信息挖掘
资助类型
生命科学
负责人
曹源
依托单位
中国人民解放军济南军区总医院
批准年份
2011
起止时间
201201-201412
批准金额
24.00万元
摘要
创伤弧菌是一类革兰氏阴性条件致病菌，易引起人类败血症和伤口感染，具有较高的致死率。目前，针对创伤弧菌调控及致病机制研究多集中在蛋白水平，而忽略了非编码小RNA（sRNA）在基因调控中所起的重要作用。为此，我们拟以创伤弧菌为研究对象，开展以下工作：①采用生物信息学方法构建细菌sRNA预测模型，对创伤弧菌进行sRNA预测；②采用RNA-Seq策略检测创伤弧菌感染过程中差异表达基因，获得相关sRNA；③用Northern blot验证上述两种方法获得创伤弧菌sRNA，并对其进行功能注释，初步探索创伤弧菌感染过程中基因调控机制。该工作的开展不仅有助于我们发现、识别具有重要调控功能的创伤弧菌sRNA，为进一步研究该菌系统进化、调控方式及致病机制奠定基础，也能为其他细菌sRNA的发现和功能研究提供技术支持和借鉴。
评论区 (0)
#插入话题
