Epigenomics：变应性鼻炎-哮喘综合征中，基因表达特性的转录调控分析
2018-01-25 AlexYang MedSci原创
最近，有研究人员进行了旨在评估在变应性鼻炎和哮喘综合症（CARAS）中，基因表达特性的转录调控情况。研究包括了3名CARAS病人、3名过敏性鼻炎病人和3名正常对照参与者的血样。研究人员利用cuffdiff、miRDeep2和DEGseq分别来来定量基因和miRNAs的表达情况，并且p值小于0.01和错误发现率小于0.001时，认为基因或者miRNAs的表达具有显著的差异。研究人员还利用GO和KEG
最近，有研究人员进行了旨在评估在变应性鼻炎和哮喘综合症（CARAS）中，基因表达特性的转录调控情况。
研究包括了3名CARAS病人、3名过敏性鼻炎病人和3名正常对照参与者的血样。研究人员利用cuffdiff、miRDeep2和DEGseq分别来来定量基因和miRNAs的表达情况，并且p值小于0.01和错误发现率小于0.001时，认为基因或者miRNAs的表达具有显著的差异。研究人员还利用GO和KEGG分析对基因和miRNAs的生物功能进行了研究。显著性的截断值为p<0.05.
研究发现，SLC14A1， SNCA， TNS1， KAT2B和PARP1受hsa-miR-93-5p， hsa-miR-92a-3p和hsa-miR-21-5p调控。另外，吞噬体（p = 0.00627769839083361）是唯一的显著富集的信号通路且涉及HLA-DOA、TUBB2A和MRC2。最后，研究人员指出，miRNAs调控下基因表达的失调也许在CARAS中具有重要作用。
原始出处：
Mao Z， Shi Y， Cao Q et al. Transcriptional regulation on the gene expression signature in combined allergic rhinitis and asthma syndrome. Epigenomics. Feb 2018.
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