PNAS:绘制癌转移的发展史

2014-04-23 佚名 生物通

肿瘤能够通过转移扩散到机体的其他部分,但人们对这一过程并不十分了解。此前,研究者们一直难以确定转移发生在原发瘤发育的什么阶段,或者特定转移瘤是否直接来自于原发瘤。现在,科学家们开发了一个简单的新方法,能够快速分析患者体内多个肿瘤位点之间的进化关系,为制定合适的治疗方案提供宝贵信息。 “构建患者体内所有肿瘤的‘家谱’,不仅可以帮助我们确定肿瘤之间的差异,还有助于了解肿瘤的发展史,”文章的通讯作

肿瘤能够通过转移扩散到机体的其他部分,但人们对这一过程并不十分了解。此前,研究者们一直难以确定转移发生在原发瘤发育的什么阶段,或者特定转移瘤是否直接来自于原发瘤。现在,科学家们开发了一个简单的新方法,能够快速分析患者体内多个肿瘤位点之间的进化关系,为制定合适的治疗方案提供宝贵信息。

“构建患者体内所有肿瘤的‘家谱’,不仅可以帮助我们确定肿瘤之间的差异,还有助于了解肿瘤的发展史,”文章的通讯作者,麻省总医院MGH的Kamila Naxerova博士说。“通常这需要进行大量的遗传分析和复杂的测序研究。不过我们的新方法,能够简单快速的达到这一目的。”这项研究于四月二十一日提前发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志的网站上。

直到最近,癌症研究者们才开始分析肿瘤之间的遗传差异,例如不同肿瘤位点之间的差异,以及原发瘤和转移瘤的差异。据介绍,目前的肿瘤转移模型主要有两种:一种认为原发瘤在发育晚期发生转移,在这种情况下原发瘤细胞和转移瘤细胞的遗传差异应该很小;另一种模型认为转移发生在肿瘤发育的早期,那么在演化之后,原发瘤和转移瘤细胞的遗传差异应该很显著。此前有研究指出,这两种模式适用于不同类型的癌症,不过这样的结论还缺乏足够的患者数据。

肿瘤的遗传多样性与疾病侵袭性或治疗抗性有何关系?回答这样的问题,需要分析大量不同类型的样本。全基因组或全外显子组测序需要用到特殊仪器和复杂的数据分析,成本也相对较高。MGH研究团队开发的新方法要简单得多,该方法只针对人类基因组的一个小区域——poly-G重复片段。这一区域对细胞分裂时出现的突变特别敏感。尽管这些突变与肿瘤发育没有直接关联,但它们可以揭示肿瘤的谱系,解析不同肿瘤细胞之间的关系。

研究团队使用的Poly-G重复片段分析法,原本是为了在小鼠中研究不同细胞之间的谱系关系,现在他们将其应用于人类癌症研究。研究人员对22名大肠癌患者的原发瘤和转移瘤样本进行了poly-G分析,他们发现原发瘤和转移瘤之间的关系可以说因人而异。

在某些患者中,肿瘤位点之间存在显著的遗传差异,说明转移发生在原发瘤发育的早期。而另一些患者中,原发瘤和转移瘤的差异很小。研究人员还发现,某些来自同一个原发瘤的转移瘤,会因为所处位置的不同而产生遗传差异。此外,某些转移瘤的遗传特征只类似于原发瘤中的某些细胞,这意味着这些细胞才是转移瘤的来源。

“我们发现,肿瘤转移有不少路径,”Naxerova说。“目前,我们正在对更大量的样本进行poly-G分析,希望解决更多与肿瘤转移有关的临床问题。poly-G分析速度快而且成本低,可以广泛用于大肠癌以外的其他肿瘤类型。”

文章的共同作者Elena Brachtel介绍道,研究中使用的是归档保存的组织。“对手术切除的组织进行诊断之后,福尔马林固定的石蜡包埋组织还可以保存数年,以便日后人们通过更先进的技术进行分析。”

文章的资深作者Rakesh K. Jain补充道,“poly-G分析有多种潜在的临床应用。例如,可以快速鉴定转移瘤的来源。”明确原发瘤和转移瘤的关系,将为人们提供重要的临床信息。


原始出处:

Kamila Naxerovaa,1, Elena Brachtelb, Jesse J. Salkc, Aaron M. Seesed, Karen Powerd, Bardia Abbasie, Matija Snuderlf, Sarah Chiangg, Simon Kasifh,i, and Rakesh K. Jaina.Hypermutable DNA chronicles the evolution of human colon cancer.PNAS January 6, 2014  doi: 10.1073/pnas.1400179111 【Supplementary Information】 

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