PLoS Genet：循环肿瘤DNA片段更短小 有助开发液体活检新技术
2016-07-20 佚名 生物谷
根据一项发表在国际学术期刊Plos Genetics上的最新研究，循环肿瘤DNA与正常游离DNA在长度上存在差别，据此或可利用病人血液帮助开发检测肿瘤DNA的液体活检新技术。 液体活检技术可以从血液中发现和诊断癌症，还可以帮助监测癌症复发，评估治疗效果，但是这项技术仍然存在监测灵敏度的问题，大大限制了该技术的发展。美国犹他大学和华盛顿大学的研究人员发现，相比于正常细胞的DNA片段，来源于肿瘤细
根据一项发表在国际学术期刊Plos Genetics上的最新研究，循环肿瘤DNA与正常游离DNA在长度上存在差别，据此或可利用病人血液帮助开发检测肿瘤DNA的液体活检新技术。
液体活检技术可以从血液中发现和诊断癌症，还可以帮助监测癌症复发，评估治疗效果，但是这项技术仍然存在监测灵敏度的问题，大大限制了该技术的发展。美国犹他大学和华盛顿大学的研究人员发现，相比于正常细胞的DNA片段，来源于肿瘤细胞的循环DNA长度更短。
文章作者Hunter Underhill表示：“根据不同来源的循环DNA片段长度不同，可以检测到实体瘤的存在。”
研究人员在多形性成胶质细胞瘤小鼠模型中发现了上述现象。在研究中他们将人的多形性成胶质细胞瘤干细胞样系导入小鼠脑部，随后在血液中检测到了人类ctDNA，他们对比了人类肿瘤来源ctDNA和小鼠正常游离DNA的差别，发现人类ctDNA的长度一般为134个碱基，而小鼠正常游离DNA长度一般为167个碱基。研究人员还将人类肝细胞癌细胞植入小鼠体内也发现了类似现象，这表明循环肿瘤DNA长度更短是相对普遍的现象。
随后研究人员还对黑色素瘤患者和健康人体内的游离DNA进行了对比，他们发现黑色素瘤患者的游离DNA片段普遍更短。他们还对比了肺癌患者和健康人的游离DNA，结果表明肺癌患者来源的游离DNA长度也更短小。
研究人员对比了来自于EGFR T790M突变肺癌患者和健康人循环DNA测序文库，结果发现当DNA片段比平均长度短20到50个碱基时，该片段等位基因的突变率提升2.5到9.1倍。这说明短的游离DNA可提示更高的等位基因突变率。
作者表示，对短的游离DNA进行准确筛查将有助于等位基因突变及肿瘤的发现，但其中的机制还需要更多研究进行进一步揭示。
原始出处
Hunter R. Underhill ,Jacob O. Kitzman,Sabine Hellwig,Noah C. Welker,Riza Daza,Daniel N. Baker,Keith M. Gligorich,Robert C. Rostomily,Mary P. Bronner,Jay Shendure.Fragment Length of Circulating Tumor DNA.PLoS Genet.2016
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