Am J Hum Genet：评估美国医学遗传学会指南|基于癌症易感性的变异分类和乳腺癌家族非癌症相关基因
2016-05-08 MedSci MedSci原创
外显子和全基因组测序检测已经可以广泛应用于癌症风险评估。然而，这类检测得出突变类型的方法尚没有进行仔细的研究。美国医学遗传学会 (ACMG) 指南定义了180个医学相关基因，包括所有ACMG指定的可报告的癌症和非癌症相关基因，对符合指南要求的遗传性癌症风险进行评估。我们评估了此指南的变异分类方法定义突变发生率和不确定意义 (VUS) 的变异的能力。我们对253个家庭的404人进行了全外显子测序，归
外显子和全基因组测序检测已经可以广泛应用于癌症风险评估。然而，这类检测得出突变类型的方法尚没有进行仔细的研究。
美国医学遗传学会 (ACMG) 指南定义了180个医学相关基因，包括所有ACMG指定的可报告的癌症和非癌症相关基因，对符合指南要求的遗传性癌症风险进行评估。我们评估了此指南的变异分类方法定义突变发生率和不确定意义 (VUS) 的变异的能力。
我们对253个家庭的404人进行了全外显子测序，归类了1640个变异。临床潜在的（可能致病的[LP]或致病的[P]）VS 不可行的(VUS, 疑似良性或良性) 的调用与特异性基因位点数据库和Clinvar有95%的一致性。在26个无识别BRCA1/2突变的家庭中，在25个乳腺癌易感基因中的12个中识别出了LP或P突变(11%)。
在两个额外的家庭中，评估了84个与常染色体显性癌症易感基因相关的额外基因，识别了LP或P突变(0.8%)。
然而，253个家族中的10人(3.9%)在32个非癌症相关基因中有偶然发生的LP或P突变，9%的人携带罕见的与常染色体隐性癌症易感基因相关的39个基因中的LP或P突变。
除此之外，95%的受试者携带至少一种VUS。总而言之，这些数据支持ACMG突变分类指南。另外，评估乳腺癌/卵巢癌家族相关基因的拓展板块表面上增加了临床益处但实际上是增加了结果的复杂性。
原始出处：
Maxwell KN1, Hart SN2, Vijai J，et al, Evaluation of ACMG-Guideline-Based Variant Classification of Cancer Susceptibility and Non-Cancer-Associated Genes in Families Affected by Breast Cancer.,Am J Hum Genet,2016 May 5;98(5):801-17. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.02.024.
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