Science：我们的寿命多大程度由基因决定？只有16%！
2018-03-05 佚名 生物探索
最新刊登在Science上的一项研究发表了可能是有史以来最大的家谱：这一里程碑式的数据集关联了有血缘或婚姻关系的1300万人，平均跨越11代。而正是基于这一庞大的家谱，科学家们得出了以上结论。
图片来源：Science（DOI: 10.1126/science.aam9309）
最新刊登在Science上的一项研究发表了可能是有史以来最大的家谱：这一里程碑式的数据集关联了有血缘或婚姻关系的1300万人，平均跨越11代。而正是基于这一庞大的家谱，科学家们得出了以上结论。
在这篇题为“Quantitative analysis of population-scale family trees with millions of relatives”的论文中，哥伦比亚大学的计算生物学家Yaniv Erlich及其同事分析了这一家谱上的人的出生和死亡日期，并评估了如果他们是近亲，是否更有可能死于相似的年龄。
结果显示，遗传只解释了这些人寿命差异的不到五分之一。大部分的差异都归结于其他因素，如，人们的居住地和生活方式。同时，研究还表明，影响长寿的基因是独立起作用，而不是相互作用。
Erlich说：“‘好的’基因可能会使一个人的寿命平均延长5年，但一些环境因素对长寿的影响更大，例如，吸烟能够减去10年寿命。”
尽管先前科学家们已经怀疑，环境对人类寿命的影响要大于基因（2001年的一项研究曾估计，基因决定了人类寿命变化的约四分之一），但这项新成果表明，基因的作用可能比研究人员想象得更少。对于致力于寻找长寿基因的科学家们来说，这意味着，实现他们的目标或许要加困难了。
This 6,000-person family tree was cleaned and organized using graph theory. Individuals are shown in green, spanning seven generations; marriages are depicited in red.Credit: Columbia University
庞大数据
事实上，遗传学家们利用家谱来研究遗传特征如何影响性状（如，疾病风险）已经有很长时间了。但是，要形成包含大量人口的家庭记录数据集，成本很高，且难度很大。目前，有很多科学家小组正在开展相关研究，其中，一些已经鉴定出了与癌症和阿尔茨海默症等疾病相关的基因。
Erlich的研究使用的是来自在线家谱工具Geni.com（全球最大的合作家谱网站之一，用户在Geni上分享他们的家谱）的数据。他现在是Geni母公司MyHeritage的首席科学官。
Erlich关于这一研究的最初想法要追溯到7年前。当时，他通过Geni.com从一个远房亲戚那里收到了一封电子邮件，然后联系了该公司的首席技术官，获得了下载该网站上数千万公开资料的权利。这些资料包括用户的姓名、性别、出生日期和地点、死亡日期以及直系亲属，但没有DNA信息。最终，他们分析了来自约8600万人的数据。
加州大学旧金山分校的计算基因组学专家Atul Butte说：“这种级别的参与者数量是疯狂的。科学家们也只能通过众包（crowdsourcing）获得这样的数据集。这真是太令人印象深刻了。”
图片来源：网络
其他发现
除了调查基因和环境对寿命的影响，Erlich团队还利用这些数据分析了人们移民和结婚的模式。结果发现，在1750年之前，数据集中的大多数美国人和欧洲人，都与“居住在离他们出生地最多10公里处的人”结婚。到1950年，大多数美国人和欧洲人都要到离家至少100公里的地方去寻找配偶。
Erlich说：“所有这些都有助于我们理解基因是如何在一个地理区域内传播的。”他还表示，目前的这些发现仅仅触及了这一庞大家谱潜在用途的表面。现在，他的团队已经开始利用一个叫DNA.Land的网站来进一步研究这一家谱。在DNA.Land上，用户会分享他们的DNA基因分型数据（这些数据来自一些公司提供的消费者DNA测试服务，如23andMe、MyHeritage），并填写健康调查。
Yaniv Erlich. (MyHeritage)
意义重大
未参与该研究的昆士兰大学遗传学家Peter Visscher说：“这项研究非常聪明地利用众包数据来解决许多有趣的科学问题。如果能够它能够与健康信息联系起来，探究基因在疾病中的作用，那么将带来更大的意义。”
犹他大学的遗传学家Lisa Cannon-Albright则表示：“Erlich等的发现证明了极大家谱的力量。这类资源将是未来遗传学研究一个强有力的部分。”
此外，牛津大学的人口统计学家Melinda Mills认为，对于公众科学（citizen science）来说，这是一个激动人心的时刻。该研究很好地展示了数以百万计的普通人如何对科学产生影响。
原始出处：
Joanna Kaplanis, Assaf Gordon, Tal Shor, et.al. Quantitative analysis of population-scale family trees with millions of relatives. Science 01 Mar 2018
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谢谢分享.学习了
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