Nature：世界上很大的人类基因组变异被解析，含26个种族2,504人的基因组
2015-10-13 MedSci MedSci原创
由***基因组计划协会领导的一个国际科学家小组，构建出了世界上最大的人类基因组变异目录，可为研究人员提供有价值的线索帮助他们确立一些人容易罹患各种疾病的原因。尽管大多数的人类基因组变异都是无害的，一些甚至是有益的，但也有些变异却可导致疾病，造成认知障碍，影响癌症、肥胖、糖尿病、心脏病和其他疾病的易感性。了解基因组变异导致疾病的机制或可帮助临床医生改进诊断及治疗方法及开发出新的防治对策。
由***基因组计划协会领导的一个国际科学家小组，构建出了世界上最大的人类基因组变异目录，可为研究人员提供有价值的线索帮助他们确立一些人容易罹患各种疾病的原因。尽管大多数的人类基因组变异都是无害的，一些甚至是有益的，但也有些变异却可导致疾病，造成认知障碍，影响癌症、肥胖、糖尿病、心脏病和其他疾病的易感性。了解基因组变异导致疾病的机制或可帮助临床医生改进诊断及治疗方法及开发出新的防治对策。
在发表于《自然》（Nature）杂志上的两篇研究论文中，研究人员检测了跨越非洲、亚洲和南亚、欧洲与美洲26个种族2,504人的基因组。
在第一篇Nature文章中，研究人员鉴别出了人类基因组中因人而异的大约8800万个位点，建立了一个数据库提供给研究人员作为标准参考，确定在种群中及世界各地人类基因组组成的变异。这一目录将人类基因组中已知变异位点增加了一倍多，现可用于广泛的人类生物学和医学研究中，为深入认识DNA遗传变异促成疾病风险及药物反应的机制奠定了基础。
在鉴别出的8800多万个变异位点中，大约1200个位点具有可能被许多种群共享的常见变异。研究显示非洲人群具有最大的基因组多样性，这与人类起源于非洲，并从非洲迁移至世界各地建立其他种群的事实相符。
国家人类基因组研究所(NHGRI)基因组变异项目主任Lisa Brooks博士说：“人类基因组中大约有8800万个位点因人而异。其中大约四分之一的变异是常见的，存在于许多或所有种群中，而大约四分之三存在于仅1%的人群中或甚至更为罕见。***基因组计划为科学家们开展研究，探究疾病中的基因组贡献，包括研究常见和罕见变异提供了一个资源。”
在第二篇Nature论文中，科学家们调查了2,504个样本中的基因组结构变异。他们发现了近6.9万个结构变异。这些基因组变异，包括缺失、插入和复制，其中许多影响了基因。研究人员构建出了8类结构变异的图谱，这些结构变异潜在地促成了疾病。
欧洲分子生物学实验室基因组生物学部负责人及欧洲研究委员会研究员Jan Korbel说：“结构变异是造成人类基因组大比例DNA变异的主要原因。从来没有研究以这样广泛的代表性来调查世界各地种群的基因组结构变异。”
Korbel和同事们发现，这些结构变异比他们原来认为的要更为复杂。例如，大多数倒位（DNA序列在基因组中改变它们的方向）常常与其他的结构改变共同发生。
密西根大学生物统计学教授、Nature研究的共同项目负责人Gonalo Abecasis说，***基因组计划的价值超越了数据。
资深作者及项目负责人Adam Auton博士说：“***基因组计划为其他人解答真正有意思的问题奠定了基础。现在每个人都想知道关于人类疾病这些变异会告诉我们些什么。”
参考文献：
1000 Genomes Project Consortium, Auton A, Brooks LD, Durbin RM, Garrison EP, Kang HM, Korbel JO, Marchini JL, McCarthy S, McVean GA, Abecasis GR.A global reference for human genetic variation.Nature. 2015 Oct 1;526(7571):68-74.
Sudmant PH, Rausch T, Gardner EJ, et al. An integrated map of structural variation in 2,504 human genomes. Nature. 2015 Oct 1;526(7571):75-81. doi: 10.1038/nature15394.
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