项目简介
项目名称
基于改进Mauve算法的贯众类药材DNA条形码序列预测与验证
项目批准号
81102764
学科分类
H2802
医学科学部
_中药学
_中药鉴定
资助类型
医学科学
负责人
马新业
依托单位
广州中医药大学
批准年份
2011
起止时间
201201-201412
批准金额
22.00万元
摘要
采用改进Mauve算法对有分类学代表性的物种的叶绿体全基因组序列进行多重比对，可以识别出特定植物类群中全部的共有且共线性基因（群）。在此基础上预测既有通用引物又包含适当变异的DNA条形码序列，是DNA条形码技术研究中的一种全局性优化的新方法，大大增强了研究逻辑性，有助于充分阐释该技术的科学内涵。本研究通过对11个蕨类植物物种（涵盖全部5个蕨类植物亚门）的叶绿体全基因组序列进行多重比对，预测适合该类群的DNA条形码，随后以60种贯众类药材为对象进行PCR扩增效率、测序成功率、序列质量状况、种内/种间变异和物种鉴定效率等内容的综合验证，最终建立起适合贯众类药材真伪鉴定的DNA条形码技术体系，是运用新技术解决中药鉴定具体问题的示范性探索。此外，本研究所采用的预测DNA条形码序列的新方法，对不同植物类群的相关研究均具有借鉴意义。
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