项目简介
项目名称
面向动态蛋白质网络的功能模块挖掘方法及其应用研究
项目批准号
61003124
学科分类
F020504
信息科学部
_计算机科学
_计算机应用技术
_生物信息计算
资助类型
信息科学
负责人
李敏
依托单位
中南大学
批准年份
2010
起止时间
201101-201312
批准金额
22.00万元
摘要
利用大规模相互作用数据构建蛋白质网络，从中挖掘功能模块对理解分子组成原理、揭示蛋白质功能及解释特定的生物进程具有十分重要的意义，是后基因组时代的研究热点。近年来对功能模块挖掘算法的研究大多是基于静态蛋白质网络展开的，无法体现真实世界中蛋白质相互作用的动态性和瞬时性。本项目主要研究面向动态蛋白质网络的功能模块挖掘算法及其应用。将结合时间序列的基因表达数据，研究动态蛋白质网络的构建及描述方法；采用图论和局部搜索技术对功能模块挖掘算法展开研究，以得到不同时间和空间通过相互作用绑定的动态功能模块；分析功能模块的保守性和进化速率，定义功能模块内蛋白质节点的拓扑参数，以预测生命活动所必须的关键蛋白质；研究功能模块动态变化在一些重大疾病预测方面的应用。本项目的研究不仅能突破原来静态蛋白质网络功能模块挖掘的局限性，还将为揭示功能模块动态变化引起人类病变的原因提供实验基础和理论依据。
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