项目简介
项目名称
发展先导化合物结构的自动优化方法及其应用
项目批准号
21072213
学科分类
B020601
化学部
_有机化学
_药物化学
_药物分子设计与合成
资助类型
化学科学
负责人
王任小
依托单位
中国科学院上海有机化学研究所
批准年份
2010
起止时间
201101-201312
批准金额
36.00万元
摘要
基于靶标结构的药物设计是当代药物设计中的主流，目前应用较多的方法有虚拟筛选和从头设计两大类。从头设计方法原则上不受已知化合物结构类型的限制，既可以用于先导化合物的优化设计，也可以用于生成全新先导化合物，但是在使用中可能存在组合爆炸、可合成性低等问题。本申请项目计划发展一种与传统的从头设计方法不同的对先导化合物进行优化设计的程序方法AT&T。该方法可以根据靶标分子结合部位的三维结构信息实现对先导化合物结构的合理剪裁，并利用虚拟筛选的结果选取合适的分子片段进行嫁接等操作，最终得到完整的高成药性的设计方案。我们计划将AT&T发展为实用化的软件，预计该方法在实践应用中可以与从头设计方法互补，并与虚拟筛选方法共同构成基于靶标结构的药物分子设计的完整解决方案。我们并将在Bcl-2家族蛋白小分子抑制剂设计中应用AT&T方法，希望能够实现全新先导化合物的发现以及对现有先导化合物的优化。
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