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Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征

Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征

该研究结果表明,基于cfNano和Illumina的WGS和WGBS方法在检测DNA甲基化、片段化和CNA的癌症特异性特征方面性能基本一致。

测序中国 - 细胞起源,纳米孔测序,检测cfDNA - 2022-08-09

BioRxiv:单氨基酸分辨率的长链蛋白质单分子纳米孔测序方法可检测完整折叠蛋白结构域

BioRxiv:单氨基酸分辨率的长链蛋白质单分子纳米孔测序方法可检测完整折叠蛋白结构域

研究团队开发了一种新方法,有望利用Oxford Nanopore公司的商用平台实现完整蛋白质链的长距离(long-range)、单分子测序。

测序中国 - 单分子测序,蛋白质链 - 2024-01-09

Cancer Res:基于长读长测序准确全面检测癌症基因融合事件的新方法:FusionSeeker

Cancer Res:基于长读长测序准确全面检测癌症基因融合事件的新方法:FusionSeeker

基于模拟和三个癌细胞系的数据,该研究证明了FusionSeeker在检测基因融合事件方面优于现有方法。

测序中国 - 癌症,基因测序 - 2022-11-25

Nat Biotechnol:迄今最连续人类基因组组装完成

Nat Biotechnol:迄今最连续人类基因组组装完成

英国《自然·生物技术》杂志 29 日在线发表了一项基因组学研究成果:英国科学家团队利用一个口袋大小的纳米孔测序装置,从头组装出人类基因组,这是迄今为止最连续的人类基因组组装,而且只用了单一测序技术。这项研究同时成功地分析了过去最先进的测序方法也分析不出的人类基因组区域。

科技日报 - 基因组 - 2018-01-30

Clin Chem:使用两种商业测序平台对结核分枝杆菌培养物进行全面耐药性分析

Clin Chem:使用两种商业测序平台对结核分枝杆菌培养物进行全面耐药性分析

由于结核分枝杆菌耐药性复杂,需要进行快速、全面的药敏试验来指导患者的治疗。

MedSci原创 - 耐药性;分析 - 2020-07-19

贺建奎博士:第三代单分子测序技术在临床上的应用

贺建奎博士:第三代单分子测序技术在临床上的应用

12月3日,由生物谷主办的2015下一代测序发展论坛:行业探讨与临床应用于上海斯波特大酒店隆重召开。深圳市瀚海基因生物科技有限公司董事长贺建奎博士参加了此次会议,并发表了题为"第三代单分子测序技术在临床上的应用"的精彩报告。 贺建奎曾于2010年在美国莱斯大学获生物物理学博士,又曾于2010-2012年在美国斯坦福大学从事人体基因检测技术的研究,并研发出国际领先的基因检测新技术,该成果发表在

生物谷 - 贺建奎,第三代单分子测序,临床应用 - 2015-12-14

NEJM:史上最快!超快纳米孔技术8小时测序基因组,找到致病基因,挽救生命

NEJM:史上最快!超快纳米孔技术8小时测序基因组,找到致病基因,挽救生命

基因组测序可以让科学家看到一个人完整的DNA序列构成,其中包含从眼睛颜色到遗传疾病的所有信息。因此,基因组测序对于诊断患者涉及DNA的疾病至关重要——一旦医生知道了特定的基因突

“生物世界”公众号 - 基因检测,纳米孔技术 - 2022-01-15

NAR:李岩强/易旸等发现细胞身份基因的调控新机制

NAR:李岩强/易旸等发现细胞身份基因的调控新机制

该论文揭示了一个“run-and-brake”模型,即细胞身份基因经历着频繁的转录和快速的RNA降解,以实现RNA表达的精确调控。

iNature - 细胞身份基因 - 2023-05-04

Nature Methods:免费软件可以辅助癌症早期诊断和治疗

Nature Methods:免费软件可以辅助癌症早期诊断和治疗

在2月20的nature methods杂志上,来自约翰霍普金斯大学、安大略癌症研究所、多伦多大学的研究团队,详细阐述了一种检测DNA额外标志—胞嘧啶甲基化的新方法。胞嘧啶是组成DNA的4个主要遗传构件之一,其甲基化会影响一些重要基因的开关方式。这样的遗传错误将造成细胞健康活动的严重破坏。检测这些甲基化标记,对于那些试图确定甲基化在各种健康问题里的精确作用的研究者来说,至关重要。但是,现有检测甲基

MedSci原创 - DNA甲基化,纳米孔测序仪,检测软件 - 2017-03-02

Nat Commun:“增强子劫持”事件决定神经母细胞瘤中ecDNA MYCN扩增子结构

Nat Commun:“增强子劫持”事件决定神经母细胞瘤中ecDNA MYCN扩增子结构

癌基因的扩增是癌症基因组的一个标志,其能够导致原癌基因的过度表达,且是致癌作用的一个关键驱动力。研究显示,多余的基因拷贝主要有两种形式:(i)染色体上的自我重复阵列(均质染色区域,HSR)以及(ii)

MedSci原创 - 神经母细胞瘤,MYCN,ecDNA,增强子劫持 - 2020-11-27

Nature:基因组学新纪元:超快速测序技术加速个性化医疗

Nature:基因组学新纪元:超快速测序技术加速个性化医疗

超快速基因组测序技术的应用,使得医生能够快速获取患者的基因信息,从而制定出更加个性化、精准的治疗方案。

生物探索 - 基因组学,测序 - 2024-02-28

【CSCO 2022前瞻】|纳米孔测序在肿瘤患者感染中的应用

【CSCO 2022前瞻】|纳米孔测序在肿瘤患者感染中的应用

感染是癌症发生发展及治疗过程中常见的并发症之一。据统计,我国有40%-50%的实体瘤患者死亡原因是感染,肺癌患者感染的几率较大,有研究表明68.18%的肺癌患者直接或间接死于肺部感染。

网络 - CSCO 2022 - 2022-10-27

基因测序首次进入太空舞台

基因测序首次进入太空舞台

近日,三名宇航员搭载俄罗斯联盟号宇宙飞船前往国际空间站,并计划在接下来的四个月中进行数百项科学实验。值得关注的是,人类将在太空环境下首次完成基因测序工作。▲参与本次任务的三名宇航员本次基因测序工作将由女病毒学家凯特·鲁宾斯(Kate Rubins)博士主导。凯特在斯坦福大学获得了生物学博士学位,在HIV、天花和埃博拉等致命病毒的基因组研究方面有着很深的造诣。在太空,她将对来自病毒、大肠杆菌、以及小

生物谷 - 基因测序 - 2016-07-11

Nature:千元基因组时代降临?

千元基因组($1,000 Genome)时代正式降临?1 月 14 日,总部位于加州圣地亚哥的 Illumina 公司 CEO Jay Flatley 宣布,该公司将在今年投产 HiSeq X Ten ,该系统“只需 1000 美元就可完成全覆盖的人类基因组测序”。《Nature》为此发表评论文章,解读即将到来的千元基因组时代。 HiSeq X Ten 系统由十个 HiSeq X 系

生物360 - 千元基因组 - 2014-01-16

PNAS:一种新型纳米孔测序技术获突破

经济高效的单分子测序平台能为人们提供很大的帮助,比如破解完整基因组序列、确定单倍型和鉴定mRNA可变剪接。为此,哥伦比亚大学的车靖岳(Jingyue Ju)和哈佛大学的George Church教授合作开发了基于纳米孔的单分子边合成边测序(SBS)系统。他们给四种核苷酸分别标记上不同的聚合物。聚合酶会将标记的核苷酸添加到延伸中的DNA链上,同时释放出聚合物标签。这些标签随后通过纳米孔,引起纳米孔电

MedSci原创 - 纳米孔,测序 - 2016-04-24

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