Nature子刊:深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒
人类微生物组的组成和功能与宿主的健康密切相关。除了细菌外,肠道微生物群中的非细菌成员(古菌、真菌和病毒)也在微生物群落的动态演替以及人类的生理、免疫、疾病等方面发挥着重要作用。
网络 - 肠道宏基因组,古菌病毒 - 2023-01-02
“古基因组”引爆热点,高通量测序在考古中的应用走进大众视野
华大智造MGISEQ-2000测序仪也已被广泛应用于各种组学研究,多篇报道也证实了MGISEQ-2000平台的性能与Illumina系列相当,并且具有更灵活的读取长度选择、更高通量和更低成本。
测序中国 - 高通量测序,古基因组 - 2022-12-10
CLIN CHEM:羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
羊膜穿刺术是一种常见的手术,其主要目的是从胎儿收集细胞对异常染色体、染色体拷贝数的改变、少量单基因至多基因缺陷进行测试,。在这里,研究人员展示了从羊水样品的细胞或游离DNA(cfDNA)对胎儿进行精确全基因组分析的可行性。使用Complete Genomics nanoarray平台,对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序,基因组覆盖率为50×。在一部分样品中,从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水,胎儿,基因组 - 2018-04-04
为你的基因组测序
世界领先基因测序公司Illumina的首席执行官(CEO)声称,他晓得了如何让消费者对基因测序感兴趣:创建一个庞大的APP应用商店来储存基因信息。据报道,Illumina近日与美国华平投资集团和苏特—希尔投资公司合作为一个叫做“Helix”(意为“螺旋”)的公司注资1亿美元,这家公司的目的是让基因测序进入互联网的主流。开一家基因测序APP商店 很多科技公司都对基因组的价值怦然心动,I
生物谷 - 基因测序,基因商店 - 2015-09-09
国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列
国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。
澎湃新闻 - 新型冠状病毒,全基因组序列 - 2020-01-30
Nature:癌症基因组图谱计划完成
在美国大型癌症基因组计划告一段落后,卵巢癌是还将进行集中测序的若干肿瘤类型之一 美国一项从遗传学角度描述1万个肿瘤的庞大计划日前正式落下帷幕。作为在2006年开始的一个斥资1亿美元的试点项目,癌症基因组图谱(TCGA)如今是国际癌症基因组联盟中最大的组成部分,该联盟由来自16个国家的科学家组成,已经发现了近1000万个与癌症相关的基因突变。
《中国科学报》 - 癌症,基因组,图谱 - 2015-01-07
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
Nat Commun:飞蝗全基因组序列被破译 暂为最大动物基因组
来自中国科学院动物研究所康乐院士领衔的团队、深圳华大基因研究院等单位的科研人员成功破译了迄今为止最大的动物基因组——飞蝗全基因组序列图谱,为揭示蝗灾暴发机制,开发可持续性治理策略及新的控制方法提供了宝贵的遗传资源
MedSci原创 - 基因组,飞蝗 - 2014-01-19
Cell:癌症基因组沉思录
癌症基因组沉思录近日,哈佛麻省Broad研究院的著名遗传学家Eric S.Lander教授与另外一位学者完成了题为“Lessons from the Cancer Genome”的文章,介绍了癌症基因组的系统性研究进展,概况了在细胞信号传导,染色体和表观遗传调控等方面发现的新癌基因Lander 教授是Broad医学院的创始人之一,人类基因组计划领导者之一
生物360 - Cell,癌症,基因组 - 2013-05-10
把基因组上传到云端
近日,Google正式推出了Google Genomics,这一产品可以让科学家把基因组数据存储在云端,并对DNA序列进行研究和共享。
果壳网 - 基因治疗 - 2014-11-11
Science:基因组怎么“藏猫猫”
随着基因测序成本直线下降,专家认为,我们的基因组将有助于医生发现疾病,拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。所谓的同态加密方法,可以帮助保持基因组隐私,就好像基因检测转移到廉价的在线云服务一样。 现有的加密技术常以数据无法使用为代价而保证数据安全的。正因为此,大多数基因序列在发送出去进行分析前
测序中国 - 基因 - 2014-03-14
NEJM综述:基因组与癌症治疗
2000年1人类基因组序列的提供激起了几轮癌症研究的热潮。一套基本上完整的蛋白编码基因的识别,加上新型转录元件如微小RNA(MicroRNA)的发现,已经助长了一次研究的暴发,这些研究采用基于阵列(Microarray)的方法,对大多数癌症类型中的基因表达模式谱进
基因组,癌症 - 2011-04-05
Nat Commun:基因编辑揭开细菌基因组秘密
由美国伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程系的赵惠民教授(音译,Huimin Zhao)带领的一个研究团队指出,他们利用一种创新的DNA工程技术,发现了隐藏在细菌基因组中的潜在的、有价值的功能每种细菌的基因组中,都含有合成不同化合物的基因。这些化合物包括天然抗生素、抗真菌剂和其它
生物通 - DNA工程技术,细菌,基因组,微生物 - 2013-12-11
STROBE-宏基因组学:指导宏基因组学研究报告的 STROBE 扩展声明
宏基因组学一词是指使用测序方法从样本中存在的所有生物体中同时识别基因组材料,其优势是比培养或其他方法具有更高的分类分辨率。应用包括病原体检测和发现、物种表征、抗菌素耐药性检测、毒力分析以及影响健康的微
Lancet Infect Dis . 2020 Oct;20(10):e251-e260. - STROBE,报告规范,宏基因组学 - 2021-09-01
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