ASCO 2023 速递:年轻结直肠癌(CRC)患者转录代谢分析!
2023-06-05 MedSci原创 MedSci原创 发表于上海
年轻组的代谢途径(氨基酸和脂类)、致癌基因(MYC靶点和NRAS靶点)和细胞过程富集。
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摘要号: 3509
对年轻发病的结直肠癌(CRC)患者进行转录代谢分析
研究背景:
50岁以上诊断为结直肠癌(CRC)的患者通常表现为晚期,以致治疗反应和临床预后均不佳。因此,年轻(小于50岁)和年长(大于50岁)CRC患者之间转录谱的差异仍然是临床上一个未知的领域。
研究方法:
本项研究使用TCGA(n = 397; . 50 = 349; , 50 = 48)和肿瘤研究信息交流网络(ORIEN)的CRC数据集(n = 460; .小于50 = 364; 大于50 = 96),将患者分为年轻和年长人群。本项分析中患者的基线特征在附表中提供。随后,研究通过差异基因表达分析(DESeq2)、基因集富集分析(GSEA)、免疫去卷积(TIMER2.0)和代谢途径分析(MetaPhOR)对患者的转录谱进行了比较和评估,然后对这些途径进行绘制以评估转录失调和预测代谢通量的模式。
研究结果:
老年组和年轻组的比较显示了大量明显差异表达的转录本(n = 2629),其中年轻组的代谢途径(氨基酸和脂类)、致癌基因(MYC靶点和NRAS靶点)和细胞过程富集。在老年组中,研究发现甲基化和组蛋白修饰、免疫反应和其他代谢途径的富集。
代谢途径分析显示,类固醇激素代谢和犬尿喹啉代谢发生了一致的改变,这在50岁以上的患者群体中基本上是上调的。此外,与CTLA4和PDL1治疗反应相关的途径在50岁以上的人群中基本上调。这种转录特征可能与针对这些途径的药物的不同临床预后和治疗反应的倾向有关。
结论:
总的来说,本项研究揭示了年轻和老年CRC人群在转录代谢谱和其他疾病驱动因素以及免疫谱方面的差异。同时研究提示,今后的研究应探索这种生物学特性作为治疗年轻CRC人群的新途径。
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