Nature：1月23日出版的《自然》杂志文章选读
2014-01-29 MedSci MedSci原创
科学家发现癌症新基因 大多数癌症基因都是以中等频率发生突变的，在某一具体肿瘤类型的五个样本中发生突变的不到 一个，所以对癌症基因的准确识别需要基于大规模取样，以便将突变率的这种异质性考虑进去。这项研究对来自超过4700个“肿瘤—正常对”的21个肿瘤类型 进行了统计分析。作者识别出33个以前不知道的基因，它们与增殖、凋亡、基因组不稳定、染色质调控、免疫逃避、
科学家发现癌症新基因
大多数癌症基因都是以中等频率发生突变的，在某一具体肿瘤类型的五个样本中发生突变的不到
一个，所以对癌症基因的准确识别需要基于大规模取样，以便将突变率的这种异质性考虑进去。这项研究对来自超过4700个“肿瘤—正常对”的21个肿瘤类型
进行了统计分析。作者识别出33个以前不知道的基因，它们与增殖、凋亡、基因组不稳定、染色质调控、免疫逃避、RNA处理和蛋白动态平衡有关。进一步的分
析表明，对某一给定的肿瘤类型，600到5000个样本也许能达到近乎饱和的程度，具体情况取决于背景突变速度。
HIV/AIDS疫苗存在的问题
“人免疫缺陷病毒-1”（HIV-1）疫苗的临床试验迄今为止是令人失望的，不是疗效低就
是没疗效（零保护）。在这篇论文中，Mario
Roederer等人分析了多疫苗方案在“猴免疫缺陷病毒”（SIV）的恒河猴模型中的效果，发现了一个关键的“二氨基酸”特征，它使病毒对中和抗体产生
抵抗力。免疫逃避的一个类似机制被发现在HIV中也起作用，说明这种类型的由疫苗引发的抗体反应也许可解释为什么在HIV疫苗试验中疗效有限。
小行星Ceres上的水蒸气
Ceres（太阳系主小行星带中的最大天体）表面上水合矿物的存在表明，那里也可能有水。
现在，由欧洲航天局的Herschel空间天文台获得的红外光谱提供的明确证据证明，在Ceres的表面上或其表面附近存在水冰。水蒸气以至少每秒
1026个分子的速度从Ceres上局限于中纬度地区的水源排放出。水的蒸发可能是由于类似彗星的升华作用或冷火山作用（在其中火山喷发的是水等挥发物而
不是熔岩）。这一发现支持提出以下观点的模型：彗星等冰质体可能是从我们想象中的将早期太阳系分成“干”的内层区域和“冰质”外层区域的“雪线”之外迁移
到小行星带内的。
大西洋对南极洲气候的影响
南极洲的气候已知受到远方、尤其是太平洋中气候状况的影响。然而迄今为止，南极半岛加速变
暖及南极海冰重新分布的原因仍不清楚。现在，Xichen
Li及同事发现，“阿蒙森海”中海平面压力的变化（这种变化影响该半岛的气温和海冰分布）可以被追溯到由“大西洋多年代振荡”（热带和北大西洋中气候变化
的一个持久驱动力）引起的海洋表面温度变化。
菌根真菌是土壤碳存储的关键
不同生态系统在居主导地位的、与植物相关的菌根真菌（与几乎所有陆地植物相关的根共生体）
的类型上有所不同。“外生菌根和杜鹃花类菌根”（EEM）真菌产生降解氮的酶，而“丛枝菌根”则不，于是便有了这样的预测：EEM生态系统中的植物将会与
分解者竞争土壤氮，因此增加土壤碳存储。本文作者通过综合一个全球数据集发现，的确是这样的：EEM生态系统中碳存储量要比由“丛枝菌根”主导的生态系统
中多70%，而且菌根类型要比土壤碳存储水平的其他决定因素更为重要。
甜菜的参照基因组序列
用甜菜制糖的工业化生产是19世纪早期在欧洲开始的，在此后的200年间常用栽培品种的糖
含量从8%增加到了18%。本期《自然》发表了甜菜的一个高质量参考基因组序列，同时还发表了与其相关的菠菜的基因组序列以及另外四种甜菜繁殖系的综合基
因组。这些基因组序列中所含信息对于在糖生成中所涉及基因的定性、对于育种工作目标的确定以及对于它作为一种可持续性能源作物的应用都将会是有用的。
艾滋病治疗的一个另类方法
CD4
T细胞（携带能够识别被病毒感染的细胞表面上的CD4抗原的受体的辅助T细胞）的丧失是艾滋病发病的根源。在这项研究中，Warner
Greene等人识别出静止的淋巴CD4
T细胞在HIV感染过程中被耗尽的机制。利用保持了天然淋巴环境的人淋巴组织的体外培养，本文作者发现，失败的病毒复制触发由“半胱天冬酶-1”介导的细
胞焦亡，后者造成细胞死亡。“半胱天冬酶-1”抑制药物（它们在临床试验中已被发现是安全的）在体外能挽救细胞死亡，这说明可能存在新的一类以主体、而不
是以病毒为作用目标的抗艾滋病治疗药物。
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