Am J Rhinol Allergy:MIR-17-5P在季节过敏性鼻炎病理中的作用研究

2019-01-23 AlexYang MedSci原创

作为最流行的鼻炎类型,过敏性鼻炎包括了季节过敏性鼻炎(SAR)和永久过敏性鼻炎。最近,有研究人员尝试阐释SAR的机制。研究人员从基因表达综合数据库中提取了基因芯片数据集GSE43523(包括了7个SAR鼻上皮细胞和5个非过敏性对照鼻上皮细胞)数据。基于limma包,研究人员对2个组进行差异表达分析来获得差异表达的基因(DEGs)。另外,研究人员对DEGs基因的功能进行了富集分析。结合Cytosca

作为最流行的鼻炎类型,过敏性鼻炎包括了季节过敏性鼻炎(SAR)和永久过敏性鼻炎。最近,有研究人员尝试阐释SAR的机制。

研究人员从基因表达综合数据库中提取了基因芯片数据集GSE43523(包括了7个SAR鼻上皮细胞和5个非过敏性对照鼻上皮细胞)数据。基于limma包,研究人员对2个组进行差异表达分析来获得差异表达的基因(DEGs)。另外,研究人员对DEGs基因的功能进行了富集分析。结合Cytoscape软件,研究人员对蛋白互作(PPI)网络进行了构建,并获得了一个显著的网络模块。研究人员还对转录因子靶标和miRNA靶标对进行了预测。研究发现,鼻炎和对照群体之间具有274个DEGs,包括了144个上调的基因和130个下调的基因。在建立了DEGs的PPI后,研究人员鉴定了一个显著的网络模块。在TF-miRNA靶标调控网络中,ABCA1, CPEB4, CD69, MIR-17-5P和CREB程度更高。更多的是,ABCA1和CD69在调控网络中均是MIR-17-5P的靶标。

最后,研究人员指出,CPEB4和CREB也许在SAR病理中是有作用的。另外,MIR-17-5P通过靶向ABCA1和CD69在SAR中也具有作用。

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