Nature Genetics：我国肝癌基因外显子组测序研究获进展
2012-08-28 何嫱 生物通
来自上海交通大学医学院、国家人类基因组南方研究中心的研究人员利用先进的外显子组测序技术对乙型肝炎病毒相关的肝癌开展了大规模的测序和分析研究。相关论文“Exome sequencing of hepatitis B virus–associated hepatocellular carcinoma”发布在8月26日的《自然遗传
来自上海交通大学医学院、国家人类基因组南方研究中心的研究人员利用先进的外显子组测序技术对乙型肝炎病毒相关的肝癌开展了大规模的测序和分析研究。相关论文“Exome sequencing of hepatitis B virus–associated hepatocellular carcinoma”发布在8月26日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。
文章的通讯作者是上海交通大学医学院瑞金医院研究员、国家人类基因组南方研究中心的韩泽广教授。主要的研究方向有医学基因组和蛋白质组学应用研究；克隆人类新基因并进行基因功能研究；肝癌发病机制。在Nature、Nature Genetics、PNAS等国内外一流学术杂志发表论文60余篇。
肝细胞癌（HCC）是全世界最常见的癌症类型之一，在全球范围内肿瘤相关性死亡因素中排名第三，全球每年有超过50万新患者。我国是肝癌高发国家，每年约有11万人死于肝癌。肝癌易发生早期转移，且有浸润至邻近及更远组织的倾向，治疗预后较差。环境因素以及慢性感染特别是乙型肝炎病毒（HBV）感染被视为是导致肝癌的重要病因，这在中国尤其流行。
在这篇文章中，研究人员采用外显子组测序确定了具有门静脉癌栓(PVTTs)、肝内转移的HBV阳性肝癌患者的体细胞突变。在331个非沉默突变（non-silent mutation）中研究人员频繁发现了C:G>A:T和T:A>A:T颠换（transversion）。值得注意的是，在110份HBV相关的肝癌样本中有14份（约占13%）ARID1A基因发生了突变。ARID1A基因负责编码SWI/SNF染色质重塑复合物的一个元件。此外，研究人员采用RNA干扰评估了91个已证实突变基因在细胞存活中的作用。结果表明其中有7个基因，包括VCAM1和CDK14有可能赋予了肝癌细胞生长和浸润能力。
这一研究为我们提供了可能与中晚期肝癌相关的体细胞突变的图谱，并为人们发现有关驱动肝癌发生及生长分子途径提供了重要的线索。
此外，近期国内的研究学者在肝癌研究中取得了一系列的突破性进展。军事医学科学院基础医学研究所的张纪岩研究员领导的研究团队证实RACK1过表达增强了JNK的活性，由此通过直接结合MKK7并提高MKK7的活性促进了肝癌生长。
第二军医大学王红阳院士课题组证实肝细胞癌起源细胞有可能是来源于在肝硬化中暴露于慢性和持续TGF-β刺激的肝祖细胞，药物抑制microRNA-216a/PTEN/Akt信号可能是预防肝癌和靶向肝脏肿瘤起源细胞治疗的一条新策略。
还有中国医学科学院和北京协和医学院的胡卓伟教授在TLR2缺陷小鼠中证实支持细胞衰老和自噬潮的免疫网络丧失促进了DEN诱导的肝癌发生和进展。
这三项研究均发布在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology上，为深入了解肝癌的发生发展分子机制提供了重要的研究数据。
原始链接:
Huang J, Deng Q, Wang Q, Li KY, Dai JH, Li N, Zhu ZD, Zhou B, Liu XY, Liu RF, Fei QL, Chen H, Cai B, Zhou B, Xiao HS, Qin LX, Han ZG.Exome sequencing of hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma. Nat Genet. 2012 Aug 26. doi: 10.1038/ng.2391.
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