副血链球菌调控因子FimR调控网络构建及其在氧化应激中的作用

负责人:耿佳宁

依托单位:中国科学院北京基因组研究所

批准年份:2012

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项目简介
项目名称
副血链球菌调控因子FimR调控网络构建及其在氧化应激中的作用
项目批准号
31200928
学科分类
C060301 生命科学部 _遗传学与生物信息学 _微生物遗传学 _原核微生物遗传
资助类型
生命科学
负责人
耿佳宁
依托单位
中国科学院北京基因组研究所
批准年份
2012
起止时间
201301-201512
批准金额
22.00万元
摘要
副血链球菌在牙菌斑和瓣膜心内膜炎发生过程中发挥着重要作用,但是对副血链球菌毒力基因的研究局限在对fap1基因簇和fimCBA-tpx 操纵子上。而调控因子如何调控毒力基因的表达,还没有报道。序列同源比对表明FimR蛋白是调控蛋白DtxR家族蛋白成员之一,这类蛋白家族在细菌中参与调控生物体内抗氧化体系蛋白表达,从而在心内膜炎发生中发挥着重要作用。前期研究表明FimR除了调控fimCBA-tpx操纵子之外,还可以结合其它一些基因,是全局调控因子,参与抗氧化应激反应。本项目利用ChIP-seq技术和RNA-seq技术相结合,鉴定直接结合基因和次级调控基因,从全基因组水平建立比较完善的FimR调控网络;利用基因突变技术,从分子水平揭示FimR如何调控毒力基因fimA和其它一些靶基因,在抗氧化应激反应中发挥作用,找到可能与心内膜炎发生有关的靶基因,为疾病的治疗提供理论基础。
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