芥子油苷代谢中microRNA的鉴定与功能分析

负责人:李晶

依托单位:东北农业大学

批准年份:2010

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项目简介
项目名称
芥子油苷代谢中microRNA的鉴定与功能分析
项目批准号
31070265
学科分类
C020409 生命科学部 _植物学 _植物生理学 _植物次生代谢与调控
资助类型
生命科学
负责人
李晶
依托单位
东北农业大学
批准年份
2010
起止时间
201101-201312
批准金额
42.00万元
摘要
芥子油苷代谢与植物防御反应密切相关,且某些芥子油苷的降解产物具有很高的抗肿瘤活性,因而其代谢及调控机制的研究备受关注。生物信息学计算和我们的初步研究结果表明芥子油苷代谢途径中存在miRNA水平的调控机制。本研究将以模式植物拟南芥为实验材料,从目前已经鉴定的芥子油苷合成与分解相关基因入手,根据最新的数据库资源和生物信息学计算获得靶向于芥子油苷代谢基因的候选miRNA, 进行实验室的分离与鉴定工作。拟采用特殊的茎环RT-PCR和Northern 杂交方法检测miRNA的表达并通过检测miRNA特异性的剪切酶DCL1的突变体中miRNA前体累积和成熟miRNA的减少,进一步确认miRNA的真实性。靶基因的鉴定主要通过5′RACE方法检测miRNA对靶基因的剪切片段。初步分析经过鉴定的miRNA在芥子油苷代谢调控中的作用,揭示芥子油苷代谢中miRNA水平上的调控机制。
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