项目简介
项目名称
利用连锁不平衡法发掘水稻种质资源群体的优异基因研究
项目批准号
30700494
学科分类
C110203
生命科学部
_生理学与整合生物学
_系统生理学
_呼吸生理
资助类型
生命科学
负责人
李金泉
依托单位
华南农业大学
批准年份
2007
起止时间
200801-201012
批准金额
19.00万元
摘要
关联定位已成为发掘种质资源群体中优异基因的重要方法。本项目围绕原计划开展三个方面的研究，主要结果有：1、构建一个含有150份水稻材料的核心种质群体，占原始资源群体的6.6%，该群体能够最大限度地保存原群体的遗传多样性；2、获得150份水稻核心种质群体的群体结构和连锁不平衡结构。利用STRUCTURE和PCoA分析发现，150份核心种质可划分为2个亚群（SG 1和SG 2），SG 1又可以进一步分为四个亚亚群。无论是整个核心种质群体，还是两个亚群、四个亚亚群，LD都在10-20cM区域显著衰减。有显著LD的block数量在11（SG 2）到56（整个核心种质群体）之间变化；3、发现一批新的和已报道的位点与12个产量及农艺性状显著关联。其中28个位点在08与09年均与目标性状显著关联，其中6个已报道过。与抽穗期显著关联的标记RM60遗传效应最小，为0.6%，与结实率显著关联的标记RM241遗传效应最大，为10.3%。已发表论文3篇，提交会议摘要2篇。
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