基于机器学习的高精度B细胞表位预测模型研究

负责人:章文

依托单位:武汉大学

批准年份:2011

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项目简介
项目名称
基于机器学习的高精度B细胞表位预测模型研究
项目批准号
61103126
学科分类
F020504 信息科学部 _计算机科学 _计算机应用技术 _生物信息计算
资助类型
信息科学
负责人
章文
依托单位
武汉大学
批准年份
2011
起止时间
201201-201412
批准金额
22.00万元
摘要
B 细胞表位预测是计算机辅助疫苗设计的重要研究内容之一,本项目探讨如何使用机器学习方法建立高精度B 细胞表位预测模型。本项目针对线性表位预测和构象表位预测展开,主要包括三个方面的研究内容:①在线性表位方面,研究机器学习框架下不等长线性表位的学习问题,克服现有模型的不足;②在基于结构的构象表位预测方面,分析影响现有方法精度的可能因素,研究包括表位与非表位不均衡问题、构象表位空间邻域表达问题、表位相关多特征融合问题,提出相应的解决方案,从而将预测精度提高到较为理想的水平;③尝试开展基于序列的构象表位预测的研究工作,挖掘序列上构象表位的分布规律,建立较为可靠的预测模型。本项目的最终目标是构建一个完整并且高精度的B 细胞表位预测系统。本项目的研究有望对疫苗和药物设计与开发,尤其是表位疫苗、治疗性疫苗和抗体药物的设计研制提供有效指导,从而节约大量的研究经费并加快疫苗的研制进程。
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