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中国青年学者联手发Science:推出三维人类脑<font color="red">细胞</font>图谱!

中国青年学者联手发Science:推出三维人类脑细胞图谱!

研究鉴定了188种不同的细胞类型,并描述了它们的分子特征。综合分析结果显示,不同细胞类型、大脑皮层区域以及基底神经节结构之间的DNA甲基化、染色质可及性、染色质组织和基因表达都呈现出协调的变化。

BioMed科技 - 三维人类脑细胞图谱 - 2023-10-15

Nat Genet:TET蛋白保证各谱系<font color="red">特异性</font>转录的快速启动

Nat Genet:TET蛋白保证各谱系特异性转录的快速启动

TET蛋白能够避免二价启动子进行甲基化,从而确保分化过程中谱系特异性转录的快速启动。

MedSci原创 - TET蛋白,甲基化,谱系分化 - 2018-01-04

新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子<font color="red">甲基化</font>谱

新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化

该文章介绍了一种纳米孔单分子测序方法,用于有效地表征癌症患者cfDNA的甲基化谱。

测序中国 - cfDNA - 2024-04-26

Cell Res:北京大学汤富酬团队开发用于单个<font color="red">细胞</font>内多组学分析的长读单<font color="red">细胞</font>测序方法

Cell Res:北京大学汤富酬团队开发用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法

该研究报道了一种用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法,scNanoCOOL-seq。

iNature - 长读单细胞测序,scNanoCOOL-seq - 2023-09-15

GUT: <font color="red">甲基化</font>循环DNA生物标志物可以用来监测转移性结直肠癌的治疗反应

GUT: 甲基化循环DNA生物标志物可以用来监测转移性结直肠癌的治疗反应

有研究报道无细胞循环DNA(cfDNA)中的突变位可以用来追踪结直肠癌(CRC)中的癌症复发。由于缺乏普遍突变的基因,该方法需要个性的基因设计。相反,我们知道早期甲基化改变局限于确定的基因组,因此可以借此来进行群体研究,本项研究的目的是确定癌症特异性甲基化生物标志物是否可以在cfDNA(液体活检)中测量,以监测转移性CRC患者(mCRC)的治疗结果

MedSci原创 - methylated,circulating,DNA,biomarker,Colorectal,Cancer - 2018-10-20

何川团队合作在Cell,Science及Nature发表32篇文章,在表观遗传领域取得重要进展(附文章列表,值得收藏)

何川团队合作在Cell,Science及Nature发表32篇文章,在表观遗传领域取得重要进展(附文章列表,值得收藏)

iNature发现(芝加哥大学)何川团队在Nature ,Science 及Cell 发表32篇研究成果及综述(从2008年到2023年为止),在表观遗传学(尤其是m6A领域)取得了重要进展。

“ iNature”公众号 - 表观遗传学,何川 - 2023-01-30

Cancer Res:汤富酬/崔恒/纪家葵合作揭示高级别浆液性卵巢癌的分子调控机制

Cancer Res:汤富酬/崔恒/纪家葵合作揭示高级别浆液性卵巢癌的分子调控机制

细胞组学测序为研究肿瘤内异质性提供了强有力的工具,此前已有一些研究利用单细胞转录组测序技术揭示了高级别浆液性卵巢癌内高度的肿瘤内异质性,但其发生发展过程中的基因组和表观基因组的变化还有待于进一步研究

“生物世界”公众号 - 卵巢癌 - 2022-08-26

Nat Commun:序列末端依赖性PCR方法——STEM-PCR,以单碱基分辨率识别<font color="red">位</font><font color="red">点</font><font color="red">特异性</font>突变

Nat Commun:序列末端依赖性PCR方法——STEM-PCR,以单碱基分辨率识别特异性突变

该方法被命名为特异性末端介导PCR,具有特异性,并且能够以单碱基分辨率识别任何序列的特异性变异。

测序中国 - STEM-PCR,位点特异性突变 - 2023-03-31

Adv Sci:中山大学聂燕/黄迪/杨林槟/宋尔卫等合作发现​基底样乳腺癌的潜在治疗新靶<font color="red">点</font>

Adv Sci:中山大学聂燕/黄迪/杨林槟/宋尔卫等合作发现​基底样乳腺癌的潜在治疗新靶

这些结果揭示了亚型特异性表观遗传激活的TF在促进和维持BLBC中起关键作用,表明POU4F1是BLBC的潜在治疗靶

iNature - POU4F1 - 2024-03-20

Cell Discovery:中山大学骆观正团队首次发现哺乳动物基因组中罕见的6mA是由RNA m6A机制通过非靶向机制引入的

Cell Discovery:中山大学骆观正团队首次发现哺乳动物基因组中罕见的6mA是由RNA m6A机制通过非靶向机制引入的

该研究证实了基于双链体DNA的N6 -脱氧腺苷促进了一种错配样结构,可能是通过DNA呼吸或碱基翻转机制。

iNature - 6mA - 2022-12-30

Science Advances:王贵华团队揭示PD-L1<font color="red">甲基化</font>抑制PD-1/PD-L1抑制剂效果

Science Advances:王贵华团队揭示PD-L1甲基化抑制PD-1/PD-L1抑制剂效果

大多数癌症类型的患者对靶向PD-1/PD-L1相互作用的治疗没有反应或只是暂时反应,多项临床试验已经提出将PD-L1阳性作为预测抗PD-1或抗PD-L1治疗反应的生物标志物。

“生物世界”公众号 - 癌细胞,PD-L1甲基化 - 2023-05-31

昆明理工大学谭韬、季维智在Cell Research发表研究文章

昆明理工大学谭韬、季维智在Cell Research发表研究文章

2月24日, 国际知名期刊Cell Research(细胞研究,影响因子14.8)以 昆明理工大学 灵长类转化医学研究院为第一及通讯作者单位在线发表了灵长类转化医学研究院谭韬和季维智课题组、中国农科院深圳农业基因组研究所高飞课题组

中国高校之窗 - 转座酶,DNA甲基化,生殖受精 - 2017-03-03

Oncogene:FOXA1的<font color="red">高</font><font color="red">甲基化</font>和 PTEN等位基因的缺失能够促进鳞状分化和膀胱癌异质性

Oncogene:FOXA1的甲基化和 PTEN等位基因的缺失能够促进鳞状分化和膀胱癌异质性

然而,肿瘤异质性的个体细胞和机制贡献是有争议的。最近,有研究人员调查了FOXA1和PTEN去激活在膀胱癌中的潜在机制,并探究了对肿瘤异质性的贡献情况。这些分析在去激活的FOXA1和PTEN中间型和腔型小鼠尿路上皮细胞中进行。研究发现,FOXA1和PTEN的去激活和表达减弱在人类疾病中广泛存在,且FOXA1和PTEN在等位基因缺失和特异

MedSci原创 - 甲基化,膀胱癌,异质性 - 2019-11-06

Nat Commun:无需预处理的新qPCR技术EpiDirect®,可直接定量DNA<font color="red">甲基化</font>

Nat Commun:无需预处理的新qPCR技术EpiDirect®,可直接定量DNA甲基化

研究团队提出了一种新型qPCR技术——EpiDirect®,其基于嵌入性核酸(INA®)经特殊引物设计后可区分甲基化和未甲基化胞嘧啶这一原理,能够使用未处理的DNA直接进行DNA甲基化的PCR定量。

测序中国 - DNA甲基化,qPCR技术 - 2023-09-11

DNA甲基化检测技术应用与技术比较

DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去 甲基化机制的发现,使得DNA甲基化研究受到广泛关注,从医学领域扩展到动植物研究当中,同时在研究方法上也取得了很大的突破。现在用于DNA甲基化检测 的方法大概有十多种,从应用上来分,大致可以分成两类:全基因组甲基化分析及特异甲基化检测。下面,我

MedSci原创 - DNA甲基化,检测 - 2014-02-05

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