巴西亚马逊P.1变种再感染率高于预期

2021-05-27 MedSci原创 MedSci原创

通过自然感染实现群体免疫的理论是不可能的。P.1引起的再感染很常见,比传统的临床病例流行病学、分子和基因组监测所检测到的更频繁。

一项对玛瑙斯市献血者的研究发现,六分之一的冠状病毒感染者再次感染了P.1变种,这一结果高于研究人员的预期,也高于其他地方对再感染的研究。这份预印本由巴西-英国虫媒病毒发现、诊断、基因组学和流行病学中心(CADDE)发表,尚未经过同行评审。研究显示P.1变种再感染的比研究人员先前想象的更常见,共同证实了通过自然感染实现群体免疫的理论是不可能的

萨比诺的团队检测了240名未接种covid-19疫苗并定期献血的献血者的抗体水平。在那些被感染的人中,16.9%的人的抗体水平随后出现了激增,这表明他们再次被感染了。作者说,实际的再感染人数可能更高,但一些血液样本采样不够频繁,不足以确诊疑似病例。“很可能再感染”的比率为25.8%,“可能再感染”的比率为31.0%。

使用雅培SARS-CoV-2 IgG CIMA根据重复献血者的抗体谱进行分类。蓝点和红点分别表示阳性和阴性,来自同一献血者的用一条线连接。

研究结果表明,“由P.1引起的再感染很常见,比传统的临床病例流行病学、分子和基因组监测所检测到的更频繁。

很少有关于再感染率的研究是通过观察抗体水平来进行的。大多数人试图用两种阳性聚合酶链反应(PCR)试验来证明再感染。但是这类病例非常罕见,科学家很难确诊,特别是在巴西等没有足够的检测渠道的国家。萨比诺告诉BMJ杂志说:“如果一个人在两个时间都有症状且PCR呈阳性,那么就限制了发现病例的机会。

CADDE的研究支持了再感染理论,并证实了P.1更善于躲避感染较老变种的人的抗体,这已经在SCIENCE杂志发表的一项研究中得到了证实。P.1有所有那些与逃逸突变相关的突变,加上它有一个增加传播能力的突变,这两个因素,再加上当地居民的行为,导致了病例数量的增加

 

马瑙斯地区COVID-19感染中P.1的测序基因组比例的时间变化和定量RT-PCR Ct值的变化趋势。

P.1流行病学特征的估计

该研究小组目前正在联系捐赠者,以确定有多少再感染病例有症状及其严重程度。

马瑙斯的COVID-19阳性病例数连续四周持续上升,加剧了人们对即将到来的第三波感染的担忧。目前,每10万人中大约有20人受到感染,这与2020年底的水平相似,那是在该市的医院崩溃和氧气供应耗尽之前的一个月。

巴西各地都在接种疫苗,但供应不足减缓了疫苗的推广。据报道,由于没有来自中国的材料,Coronavac疫苗的生产上周在圣保罗被叫停。一些巴西参议员指称,巴西对待中国的方式阻碍了巴西获得全球疫苗供应。圣保罗州长将最新的延迟归咎于巴西总统Jair Bolsonaro引发了巴西与中国的外交争端。这一指控发生之际,巴西政府正在对其未能控制大流行展开官方调查。大流行已导致至少45万人死亡。

原文出处

1、Reinfection by the SARS-CoV-2 P.1 variant in blood donors in Manaus, Brazil. Carlos A. Prete Jr, Lewis F. Buss, Claudia M. M. Abrahim, Tassila Salomon, Myuki A. E. Crispim, Marcio K. Oikawa, Renata Buccheri, Eduard Grebe, Allyson G. da Costa, Nelson A. Fraiji, Maria do P. S. S. Carvalho, Neal Alexander, Nuno R. Faria, Christopher Dye, Vítor H. Nascimento, Michael P. Busch, Ester C. Sabino medRxiv 2021.05.10.21256644; doi: https://doi.org/10.1101/2021.05.10.21256644

2、Taylor LCovid-19: Researchers find higher than expected reinfections with P.1 variant among the Brazilian Amazon BMJ 2021; 373 :n1353 doi:10.1136/bmj.n1353

3、Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, et al. Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science2021;372:815-21. doi:10.1126/science.abh2644 pmid:33853970

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