lncRNA-TCONS_00008552在先天性心脏病肺动脉高压患者中的表达
2023-03-11 刘少飞 MedSci原创 发表于上海
研究发现 lncRNA-TCONS_00008552有望成为PAH的新治疗靶点和生物标志物。
研究背景：
长链非编码 RNA (lncRNA) 是多种心血管疾病的潜在调节因子。 因此，肺动脉高压（PAH）存在一系列差异表达的lncRNAs，可作为诊断PAH甚至预测预后的标志物。 然而，它们的具体机制在很大程度上仍然未知。 因此，我们研究了 lncRNA 在 PAH 患者中的生物学作用。
研究方法及研究结果：
首先，我们筛选了继发于室间隔缺损 (VSD) 的 PAH 患者和没有 PAH 的 VSD 患者，以评估两组之间 lncRNA 和 mRNA 表达的差异。 我们的结果显示 PAH 患者中 813 个 lncRNA 和 527 个 mRNA 显着上调，541 个 lncRNA 和 268 个 mRNA 显着下调。
然后，我们在构建的蛋白质-蛋白质相互作用网络中鉴定了 10 个中枢基因。 接下来，我们进行了生物信息学分析，包括 Gene Ontology 和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 通路分析，随后构建了编码-非编码共表达网络。 我们筛选了 lncRNA-TCONS_00008552 和 lncRNA-ENST00000433673 作为候选基因，并使用定量逆转录 PCR 验证了 lncRNA 的表达水平。 尽管PAH组血浆中lncRNA-TCONS_00008552的表达水平较对照组显着升高，但lncRNA-ENST00000433673的表达在两组间无显着差异。 该研究加深了我们对 lncRNA 在 PAH 发生和发展中的作用的理解，并表明 lncRNA-TCONS_00008552 是 PAH 的一种新型潜在分子标记。
研究结论：
总之，我们的研究使用生物芯片和生物信息学技术来揭示 PAH 患者中差异表达的 lncRNA 和 mRNA。 然而，差异表达的 lncRNA 和 mRNA 的数量很大，功能仍不清楚。 特别是，关键的 lncRNA 和 mRNA 需要使用细胞实验和临床样本进行进一步验证。 我们的结果表明，lncRNA-TCONS_00008552 可能作为 PAH 发生和发展相关基因的激活剂或抑制剂，这值得进一步研究。 lncRNA-TCONS_00008552有望成为PAH的新治疗靶点和生物标志物。
参考文献：
Yang Q, Fan W, Lai B, Liao B, Deng M. lncRNA-TCONS_00008552 expression in patients with pulmonary arterial hypertension due to congenital heart disease. PLoS One. 2023 Mar 9;18(3):e0281061. doi: 10.1371/journal.pone.0281061. PMID: 36893166.
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